Basic Information

Symbol
IL21R
RNA class
mRNA
Alias
Interleukin 21 Receptor CD360 Novel Interleukin Receptor Interleukin-21 Receptor IL-21 Receptor NILR CD360 Antigen IL-21R IMD56
Location (GRCh38)
16:27402174-27452050
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_181078.3
Sequence length
4837.0 nt
GC content
0.5671

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2040.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2119.48 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1256.04
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_021798.4 NCBI
AGAUAGAGGAGCUCUUUGGGAAGAGACGCCGGGCAGGCAGAAGCAGCAG… 4483 nt 0.5623
NM_181078.3 NCBI
ACUCUGCACAUGCGGCUGGGUGGCAGCCAGCGGCCUCAGACAGACCCAC… 4837 nt 0.5671
NM_181079.5 NCBI
ACUCUGCACAUGCGGCUGGGUGGCAGCCAGCGGCCUCAGACAGACCCAC… 4978 nt 0.5673
Summary

The protein encoded by this gene is a cytokine receptor for interleukin 21 (IL21). It belongs to the type I cytokine receptors, and has been shown to form a heterodimeric receptor complex with the common gamma-chain, a receptor subunit also shared by the receptors for interleukin 2, 4, 7, 9, and 15. This receptor transduces the growth promoting signal of IL21, and is important for the proliferation and differentiation of T cells, B cells, and natural killer (NK) cells. The ligand binding of this receptor leads to the activation of multiple downstream signaling molecules, including JAK1, JAK3, STAT1, and STAT3. Knockout studies of a similar gene in mouse suggest a role for this gene in regulating immunoglobulin production. Three alternatively spliced transcript variants have been described. [provided by RefSeq, Jul 2010]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the IL21R is involved in Th1 and Th2 cell differentiation and Th17 cell differentiation pathways, as identified through KEGG analysis of dysregulated mRNAs in a radiation-induced lung injury model [Li et al. DOI:10.1177/1559325819891012].