Basic Information
Symbol
IL25
RNA class
mRNA
Alias
Interleukin 25
IL-17E
IL-25
IL17E
Interleukin-17E
Interleukin-25
Interleukin 17E
Location (GRCh38)
14:23372809-23376403
Forensic tag(s)
-
MANE select
Transcript ID
NM_172314.2
Sequence length
1167.0 nt
GC content
0.5433
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-429.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-447.34 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
305.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| CUCAAGUCACUCCCUAAAAAGACAGUGGAAAUAAAUUUGAAUAAACAAA… | 1367 nt | 0.5523 | |
| CUCAAGUCACUCCCUAAAAAGACAGUGGAAAUAAAUUUGAAUAAACAAA… | 1167 nt | 0.5433 |
Summary
The protein encoded by this gene is a cytokine that shares sequence similarity with interleukin 17. This cytokine can induce NF-kappaB activation, and stimulate the production of interleukin 8. Both this cytokine and interleukin 17B are ligands for the cytokine receptor IL17BR. Studies of a similar gene in mice suggest that this cytokine may be a pro-inflammatory cytokine favoring the Th2-type immune response. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Mar 2010]
Forensic Context
No relevant information is available at the moment.