Basic Information

Symbol
IL33
RNA class
mRNA
Alias
Interleukin 33 NF-HEV IL1F11 C9orf26 DVS27 Nuclear Factor From High Endothelial Venules Nuclear Factor For High Endothelial Venules Interleukin-1 Family Member 11 DVS27-Related Protein Interleukin-33 DKFZp586H0523 Chromosome 9 Open Reading Frame 26 (NF-HEV) Interleukin-1 Family, Member 11 IL-1F11 NFEHEV NFHEV IL-33
Location (GRCh38)
9:6215136-6257983
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_033439.4
Sequence length
2685.0 nt
GC content
0.3482

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-613.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -666.83 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 646.58
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001199640.2 NCBI
ACAGAGCUGCAGCUCUUCAGGGAAGAAAUCAAAACAAGAUCACAAGAAU… 2559 nt 0.3497
NM_001199641.2 NCBI
ACAGAGCUGCAGCUCUUCAGGGAAGAAAUCAAAACAAGAUCACAAGAAU… 2307 nt 0.3394
NM_001314044.2 NCBI
ACAGAUGCCAAACGAGAUGGAGAGAGGGUGAGUAGGAGCAAAAUUUCUC… 2693 nt 0.3491
NM_001314045.2 NCBI
AAAUACUACAAUUGCUGACUACAGGAAACCUCAUCAUCUGAGACCAGCA… 2701 nt 0.3469
NM_001314046.2 NCBI
ACAGAGCUGCAGCUCUUCAGGGAAGAAAUCAAAACAAGAUCACAAGAAU… 2667 nt 0.3483
NM_001314047.2 NCBI
ACAGAUGCCAAACGAGAUGGAGAGAGGGUGAGUAGGAGCAAAAUUUCUC… 2675 nt 0.3492
NM_001314048.2 NCBI
ACAGAGCUGCAGCUCUUCAGGGAAGAAAUCAAAACAAGAUCACAAGAAU… 2559 nt 0.3435
NM_001353802.2 NCBI
GACUUACUCACUGCUGCCUUCCACCAUCAGAUGAUCCUCACCAGAUGCC… 2622 nt 0.3497
NM_033439.4 NCBI
ACAGAGCUGCAGCUCUUCAGGGAAGAAAUCAAAACAAGAUCACAAGAAU… 2685 nt 0.3482
Summary

The protein encoded by this gene is a cytokine that binds to the IL1RL1/ST2 receptor. The encoded protein is involved in the maturation of Th2 cells and the activation of mast cells, basophils, eosinophils and natural killer cells. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2015] CIViC Summary for IL33 Gene

Forensic Context

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