Basic Information

Symbol
IL4I1
RNA class
mRNA
Alias
Interleukin 4 Induced 1 FIG1 L-Amino-Acid Oxidase IL4-Induced Protein 1 HIL4I1 LAAO LAO Interleukin-4-Induced Protein 1 Interleukin Four Induced 1 Fig-1 Protein Protein Fig-1 EC 1.4.3.25 EC 1.4.3.2 HFIG1
Location (GRCh38)
19:49889654-49929539
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_152899.2
Sequence length
1795.0 nt
GC content
0.6418

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-791.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -820.95 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 377.41
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001258017.2 NCBI
GAUUCCCCGCUCGCGACUCCCCACCCCCCAGGGCUCCCUAAAGAGGGCC… 2290 nt 0.6131
NM_001258018.2 NCBI
GAUUCCCCGCUCGCGACUCCCCACCCCCCAGGGCUCCCUAAAGAGGGCC… 2372 nt 0.6092
NM_001385639.1 NCBI
AGUGGAGGGCAGUGGAGAGGACCGCGCUGUCCUGCUGUCACCAAGAGCU… 1684 nt 0.6407
NM_152899.2 NCBI
AGUGGAGGGCAGUGGAGAGGACCGCGCUGUCCUGCUGUCACCAAGAGCU… 1795 nt 0.6418
NM_172374.3 NCBI
GAUUCCCCGCUCGCGACUCCCCACCCCCCAGGGCUCCCUAAAGAGGGCC… 2314 nt 0.6145
Summary

This gene encodes a secreted L-amino acid oxidase protein which primarily catabolizes L-phenylalanine and, to a lesser extent, L-arginine. The expression of this gene is induced by the cytokine interleukin 4 in B cells. This gene is also expressed in macrophages and dendritic cells. This protein may play a role immune system escape as it is expressed in tumor-associated macrophages and suppresses T-cell responses. This protein also contains domains thought to be involved in the binding of flavin adenine dinucleotide (FAD) cofactor. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. Some transcripts of this gene share a promoter and exons of the 5' UTR with the overlapping NUP62 gene. [provided by RefSeq, Jul 2020]

Forensic Context

A study in zebrafish demonstrated that the IL4I1 transcript, an immunity-related oxidase, increased in abundance at 9 hours postmortem [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267].