Basic Information

Symbol
IL5RA
RNA class
mRNA
Alias
Interleukin 5 Receptor Subunit Alpha CDw125 CD125 IL5R Interleukin-5 Receptor Subunit Alpha Interleukin 5 Receptor, Alpha IL-5 Receptor Subunit Alpha IL-5R Subunit Alpha CD125 Antigen Interleukin-5 Receptor Alpha Chain Interleukin 5 Receptor Type 3 IL-5R-Alpha HSIL5R3 IL-5RA
Location (GRCh38)
3:3066324-3126613
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_175726.4
Sequence length
5739.0 nt
GC content
0.4475

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1704.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1817.96 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1560.60
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000564.5 NCBI
AAACAAAACAGAAAUGCAACGCUUUAGAGUACCCACGGAAAACUUGUUU… 5808 nt 0.4461
NM_001243099.2 NCBI
AAACAAAACAGAAAUGCAACGCUUUAGAGUACCCACGGAAAACUUGUUU… 5654 nt 0.4491
NM_175724.2 NCBI
AAACAAAACAGAAAUGCAACGCUUUAGAGUACCCACGGAAAACUUGUUU… 2052 nt 0.4284
NM_175725.3 NCBI
AAACAAAACAGAAAUGCAACGCUUUAGAGUACCCACGGAAAACUUGUUU… 1718 nt 0.4464
NM_175726.4 NCBI
AAACAAAACAGAAAUGCAACGCUUUAGAGUACCCACGGAAAACUUGUUU… 5739 nt 0.4475
NM_175727.2 NCBI
AAACAAAACAGAAAUGCAACGCUUUAGAGUACCCACGGAAAACUUGUUU… 1983 nt 0.4317
NM_175728.3 NCBI
AAACAAAACAGAAAUGCAACGCUUUAGAGUACCCACGGAAAACUUGUUU… 1649 nt 0.4512
Summary

The protein encoded by this gene is an interleukin 5 specific subunit of a heterodimeric cytokine receptor. The receptor is comprised of a ligand specific alpha subunit and a signal transducing beta subunit shared by the receptors for interleukin 3 (IL3), colony stimulating factor 2 (CSF2/GM-CSF), and interleukin 5 (IL5). The binding of this protein to IL5 depends on the beta subunit. The beta subunit is activated by the ligand binding, and is required for the biological activities of IL5. This protein has been found to interact with syndecan binding protein (syntenin), which is required for IL5 mediated activation of the transcription factor SOX4. Several alternatively spliced transcript variants encoding four distinct isoforms have been reported. [provided by RefSeq, Jul 2011]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the IL5RA was significantly dysregulated in lung tissue following 12 Gy thoracic irradiation, where it was involved in the hematopoietic cell lineage pathway as part of a broader competing endogenous RNA network associated with radiation-induced lung injury [Li et al. DOI:10.1177/1559325819891012].