Basic Information
Symbol
ANKRD1
RNA class
mRNA
Alias
Ankyrin Repeat Domain 1
CARP
C-193
CVARP
MCARP
ALRP
Ankyrin Repeat Domain-Containing Protein 1
Ankyrin Repeat Domain 1 (Cardiac Muscle)
Cytokine-Inducible Gene C-193 Protein
Cytokine-Inducible Nuclear Protein
Cardiac Ankyrin Repeat Protein
Epididymis Secretory Sperm Binding Protein
Liver Ankyrin Repeat Domain 1
BA320F15.2
HA1A2
C193
Location (GRCh38)
10:90912092-90921091
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
Forensic psychiatry evaluation
Mechanical injury analysis
MANE select
Transcript ID
NM_014391.3
Sequence length
1790.0 nt
GC content
0.4207
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-482.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-515.85 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
601.30
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| AGGGCCAACUCCAGGGAUUCCUUCCACGACAGAAAAACAUACAAGACUC… | 1790 nt | 0.4207 |
Summary
The protein encoded by this gene is localized to the nucleus of endothelial cells and is induced by IL-1 and TNF-alpha stimulation. Studies in rat cardiomyocytes suggest that this gene functions as a transcription factor. Interactions between this protein and the sarcomeric proteins myopalladin and titin suggest that it may also be involved in the myofibrillar stretch-sensor system. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
A study in humans identified the ANKRD1 as significantly downregulated at the RNA level specifically in cardiomyocytes of sudden unexplained death in schizophrenia (SUD-SCZ) cases compared to controls, implicating its role in cardiac contractility and calcium homeostasis [Chen et al. DOI:10.1016/J.Forsciint.2025.112646]. A study in humans demonstrated that the ANKRD1 mRNA was differentially expressed in pericontusional brain tissue following traumatic brain injury, showing down-regulation by 27% in patient T3 and 43% in patient T6 compared to control tissue [Michael et al. DOI:10.1016/j.jocn.2004.11.003].