Basic Information

Symbol
IL6R
RNA class
mRNA
Alias
Interleukin 6 Receptor Gp80 Membrane Glycoprotein 80 IL-1Ra CD126 IL-6R IL6RA Interleukin-6 Receptor Subunit Alpha IL-6 Receptor Subunit Alpha CD126 Antigen IL-6RA Interleukin 6 Receptor Subunit Alpha IL-6R Subunit Alpha IL-6R-Alpha IL-6R-1 IL-6R 1 IL6QTL HIES5 IL6RQ IL6Q
Location (GRCh38)
1:154405193-154469450
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HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000565.4
Sequence length
5764.0 nt
GC content
0.5121

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2086.44 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2188.99 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1378.34
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000565.4 NCBI
AAAUGUUUUCCUGCGUUGCCAGGACCGUCCGCCGCUCUGAGUCAUGUGC… 5764 nt 0.5121
NM_001206866.2 NCBI
AAAUGUUUUCCUGCGUUGCCAGGACCGUCCGCCGCUCUGAGUCAUGUGC… 1887 nt 0.5919
NM_001382769.1 NCBI
AAAUGUUUUCCUGCGUUGCCAGGACCGUCCGCCGCUCUGAGUCAUGUGC… 5863 nt 0.5122
NM_001382770.1 NCBI
AAAUGUUUUCCUGCGUUGCCAGGACCGUCCGCCGCUCUGAGUCAUGUGC… 5857 nt 0.5122
NM_001382771.1 NCBI
AAAUGUUUUCCUGCGUUGCCAGGACCGUCCGCCGCUCUGAGUCAUGUGC… 5812 nt 0.5131
NM_001382772.1 NCBI
AAAUGUUUUCCUGCGUUGCCAGGACCGUCCGCCGCUCUGAGUCAUGUGC… 5758 nt 0.5122
NM_001382773.1 NCBI
AAAUGUUUUCCUGCGUUGCCAGGACCGUCCGCCGCUCUGAGUCAUGUGC… 5718 nt 0.5126
NM_001382774.1 NCBI
AAAUGUUUUCCUGCGUUGCCAGGACCGUCCGCCGCUCUGAGUCAUGUGC… 5404 nt 0.5048
NM_181359.3 NCBI
AAAUGUUUUCCUGCGUUGCCAGGACCGUCCGCCGCUCUGAGUCAUGUGC… 5670 nt 0.5116
Summary

This gene encodes a subunit of the interleukin 6 (IL6) receptor complex. Interleukin 6 is a potent pleiotropic cytokine that regulates cell growth and differentiation and plays an important role in the immune response. The IL6 receptor is a protein complex consisting of this protein and interleukin 6 signal transducer (IL6ST/GP130/IL6-beta), a receptor subunit also shared by many other cytokines. Dysregulated production of IL6 and this receptor are implicated in the pathogenesis of many diseases, such as multiple myeloma, autoimmune diseases and prostate cancer. Alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been identified in this gene. A pseudogene of this gene is found on chromosome 9. [provided by RefSeq, Aug 2020]

Forensic Context

A study in pigs demonstrated that the IL6R was uniquely upregulated in the skeletal muscle of cold-exposed Bama pigs, a cold-sensitive breed, as part of a distinct transcriptional response involving inflammatory and immune-related pathways [Yang et al. DOI:10.3390/ijms24087431].