Basic Information
Symbol
IL9R
RNA class
mRNA
Alias
Interleukin 9 Receptor
CD129
Interleukin-9 Receptor
IL-9 Receptor
IL-9R
CD129 Antigen
Location (GRCh38)
X:155997696-156013017
Forensic tag(s)
-
MANE select
Transcript ID
NM_002186.3
Sequence length
2038.0 nt
GC content
0.5967
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-872.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-906.59 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
482.28
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((.(((((((......))))))))))..((((..((((((.((((.(((((...(((((((..(((...(((((((.(((.((((((.(((((.(((((((((((.(((((.((.((((.(((((((((.....((((...))))((((........))))))))))))))))).)).))))).....(((((((((((.(((((.(((((...(((((.....((((..................)))).(((....(((((((((((.((((....)))).((((((....).)))))((((((((((((((.....((((....(((((((((((....(((((.(((((......)))))))))).)).))))))))))))).((((.......))))...(((.....))).(((((.((((((...(((((.(((..((((((....(((((((...(((...((((.((....)).))))...))).....))).))))..))))))))).)))))((.(((....)))))(((((.(((.(((......))))))....((((((((((((((((............((((....)))).))).)))))))..))))))...((((((....))))))...((.(((..(((....((((((....)))))).......)))..))).))..((((((((((((((((....))))))))))......)))))).)))))....)))))).))))))))).))))))))))......)))))))))))..)))((((.(((((((((((((.((((..(((((...........(((((((((.......(((((((.((((.(((.(((((((....((((.((.(((.....((((.((((((((((((.....((((((((((...((.(.((((((((((((((...))))).)))(((((((((........)).)))))))........(((.(((((..((((........(.((((....)))).)..(((((...))))).))))))))).)))(((((((.(((((((....(((((((((((..((.((.(((.(.....).)))...)).))..)))).))))))).))))))))))).)))....))).)))...).))...))))))))))....)))).))))((((..((....)).)))))))))))).)))..)))))))))))))..(((((((.((((.(((.(.((((...........)))).)..))).)))))))).)))........))))))))))))))..)))))))))....))))).((.((....)).))((((((..(((..(((.....)))...))).)))))).((((((..(((........))))))))))))).))))))).)))...)))))))..((((((.(((((.((((.......(((((((((((.((((((.(((((.....)).)))..)))))).)))).))))))).)))).))))).))))))....((((((((...(((.(((((((((((((((((.((((((((((((((.((((((...)))))).)).........((((.((.(((.(((((((((...)))))))))))).)).))))))).))))).)))))))...........)))))))......)))))))))).))))))))(((.(((((((((.(((((((((.((((.((..(.((......)).)..)).)))).).)))))))).))))..))))).))).....))))).....)).))).))))).))))).))))))..)))))).......))))).))))))))))).)))))))))).....))).....(((((......)))))......))))))).)))))))....)))))))).))))..((((((((((((...)))))))......))))).....((.((((....)))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((.(((((((......))))))))))..((((..((((({{((((.(((((...(((((((..(((...(((((((.(((.(((((,{((((({((,,((((((,.((((({((.((((.(((((((((.....((((...))))(((,...||...})),)))))))))))))})).)))))..}}.,,{(((((((({,,((({((((({..{{,||}}...|||,.(((((......,,.((...,},..},,}}(((((((((((.((((....)))).((((((....)})))))((((((((((((((.,...((({...,((((((((({{....(((((.(((((......)))))))))).}}.)))))))))}}}}.({{{,..,..,}))}.,,{{,.....,,,.(((((.{{(({,...(((((.(((..((((((.,..(((((((...(((...((((.((....)).))))...))).....)))}})))..))))))))).))))).,..,,..,,||}|{(((({.(((.(((......)))))}....((((((((((((((((............((((....)))).))),}))))))..)))))).|.((((((....))))))|.,{,,(((,.(((.,..((((((....))))))..,....}))..})}.)).,|||{{{((((((((({....))))))))))......)))))).)))))}...)))))).))))))))).))))))))))......))))))))))).))))}.(({(((((({{,.,.}}}.,},))))}}....((((,,((.(((((((((((((((...))))))((((((,,{,...{((((((((({,....,,..((((((((,...,((((......((((((((((...((.{,,,((((((((((((...})))).},,(((((((((........)).))))))).,{.{{{{({{.{{{{{,,,,,{..,{{{..{,{(({....}))}.}))|{|||,.}))))}})}|,|||},.,))|{(((((.(((((((....(((((((((((..((.((.(((.(.....).)))...)).))..)))).))))))).)))))))))))}})),..,)},,}))}}))},),,.)))))))))).((((((((......))))))))...(((((,({.{.((|.,.(({((((((((((.....,,.((((.((((.(((.,.((({{{,....,...}))),)}.))).)))))))).}))))).)).))}})))}))}}}}),))))).)))))))))))).}|{,||.}},)),)}|||||}..,,,..........))))))}}))(((((((.((((((.(((........))).)))).{{,..{{.{{{..(((((((((((((..((((((.(((((.((((.......(((((((((((.((((((.(((((.....)).))).}),)))).)))).))))))).)))).))))).)))))).})).))...}))))))).)))}|,}|||{((,((,{((((((((((((((.((((((...}))))).))........,((((.((.(((.(((((((({...}))))))))))).)).)))))))}}}))).))))))).}}..{,{{{.,,,)))))}}),)))))))))))))))).)))))))(((((((((.((((((((,{((((.((..,.{{......}).)..)).)))).).)))))))).))))..)))))})))}.,..)))))}}}}}))},,)})),,,.,,,,|.||||},,,|||}}},,,..,.))))).,)))))))))).)))))))))).....))).....(((((......)))))......))))))).)))))))....)))))))).))))..((((((((((((...)))))))......))))).....,{.((((....)))).),
Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| GCUGUGCACCCAGAGAUAGUUGGGUGACAAAUCACCUCCAGGUUGGGGA… | 2038 nt | 0.5967 | |
| GCUGUGCACCCAGAGAUAGUUGGGUGACAAAUCACCUCCAGGUUGGGGA… | 2042 nt | 0.5989 |
Summary
The protein encoded by this gene is a cytokine receptor that specifically mediates the biological effects of interleukin 9 (IL9). The functional IL9 receptor complex requires this protein as well as the interleukin 2 receptor, gamma (IL2RG), a common gamma subunit shared by the receptors of many different cytokines. The ligand binding of this receptor leads to the activation of various JAK kinases and STAT proteins, which connect to different biologic responses. This gene is located at the pseudoautosomal regions of X and Y chromosomes. Genetic studies suggested an association of this gene with the development of asthma. Multiple pseudogenes on chromosome 9, 10, 16, and 18 have been described. Alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No relevant information is available at the moment.