Basic Information

Symbol
ANKRD11
RNA class
mRNA
Alias
Ankyrin Repeat Domain Containing 11 ANCO1 ANCO-1 LZ16 T13 Ankyrin Repeat Domain-Containing Protein 11 Ankyrin Repeats Containing Cofactor 1 Ankyrin Repeat-Containing Cofactor 1 Ankyrin Repeat Domain 11 Nasopharyngeal Carcinoma Susceptibility Protein
Location (GRCh38)
16:89267619-89490561
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_013275.6
Sequence length
9301.0 nt
GC content
0.5803

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3502.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3655.09 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2257.90
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001256182.2 NCBI
AGAGGCCGCCCUGAGACGGUGCGCGAUGGACCGAGGGCCCCAGCCGGGG… 9372 nt 0.5802
NM_001256183.2 NCBI
AGAGGCCGCCCUGAGACGGUGCGCGAUGGACCGAGGGCCCCAGCCGGGG… 9298 nt 0.5802
NM_013275.6 NCBI
AGAGGCCGCCCUGAGACGGUGCGCGAUGGACCGAGGGCCCCAGCCGGGG… 9301 nt 0.5803
Summary

This locus encodes an ankryin repeat domain-containing protein. The encoded protein inhibits ligand-dependent activation of transcription. Mutations in this gene have been associated with KBG syndrome, which is characterized by macrodontia, distinctive craniofacial features, short stature, skeletal anomalies, global developmental delay, seizures and intellectual disability. Alternatively spliced transcript variants have been described. Related pseudogenes exist on chromosomes 2 and X. [provided by RefSeq, Jan 2012]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.