Basic Information

Symbol
INO80C
RNA class
mRNA
Alias
INO80 Complex Subunit C HIes6 C18orf37 IES6 IES6 Homolog FLJ38183 Chromosome 18 Open Reading Frame 37 IES6 Homolog (S. Cerevisiae)
Location (GRCh38)
18:35452230-35497979
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_194281.4
Sequence length
943.0 nt
GC content
0.4878

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-287.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -303.63 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 173.71
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001098817.2 NCBI
AUCAAGACGGAAGUAACAGCGGAAAGGAAGUUCCAAGGCCCGCGCUGGG… 1051 nt 0.4995
NM_001308064.2 NCBI
GUUGGGGUUGAAAGACGCUGCCCCGCGGAGUGAAUGACUACUCUUUCCC… 804 nt 0.4577
NM_194281.4 NCBI
AUCAAGACGGAAGUAACAGCGGAAAGGAAGUUCCAAGGCCCGCGCUGGG… 943 nt 0.4878
Summary

Involved in several processes, including chromatin remodeling; regulation of chromosome organization; and regulation of nucleobase-containing compound metabolic process. Located in cytosol; fibrillar center; and nucleoplasm. Part of Ino80 complex and MLL1 complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mouse cardiac mesenchymal stem cells demonstrated that HDAC11 overexpression activated chromosome organization pathways, including the upregulation of the chromatin remodeling factor INO80C mRNA, which was part of the transcriptional reprogramming that promoted cell cycle progression and proliferation [Zhang et al. DOI:10.3390/biom15050662].