Basic Information

Symbol
INPP4B
RNA class
mRNA
Alias
Inositol Polyphosphate-4-Phosphatase Type II B Inositol Polyphosphate-4-Phosphatase, Type II, 105kDa Type II Inositol 3,4-Bisphosphate 4-Phosphatase Inositol Polyphosphate 4-Phosphatase Type II EC 3.1.3.66 Inositol Polyphosphate 4-Phosphatase II; 4-Phosphatase II Inositol Polyphosphate-4-Phosphatase, Type II, 105kD
Location (GRCh38)
4:142023160-142847432
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001101669.3
Sequence length
8743.0 nt
GC content
0.3706

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2176.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2348.30 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2376.82
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001385459.1 NCBI
AUAUCUGGAAUACAAAGUUGUUGCUGCCAGUGAUUUGAGGAAUUCUAAU… 3634 nt 0.3938
NM_001385460.1 NCBI
AUAUGCAGAGAAAAUUAUAGUUAGUGAAACAACUCUGGGUGCUGUAUUU… 3699 nt 0.3928
NM_001385461.1 NCBI
AUUCUCAUGUGUCACUUGCGUGCUGCCAACUACAGUUGCUGCCUUAUUG… 8221 nt 0.3649
NM_003866.3 NCBI
AGCCGGAGAGCCAGCCGCGCUGGUGACAACUUCUCUGGGGCGCGCGCGG… 9083 nt 0.3805
Showing 31 to 34 of 34 entries
Summary

INPP4B encodes the inositol polyphosphate 4-phosphatase type II, one of the enzymes involved in phosphatidylinositol signaling pathways. This enzyme removes the phosphate group at position 4 of the inositol ring from inositol 3,4-bisphosphate. There is limited data to suggest that the human type II enzyme is subject to alternative splicing, as has been established for the type I enzyme. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human keratinocytes demonstrated that the INPP4B was downregulated (0.65-fold) following 5 Gy X-ray irradiation [Koike et al. DOI:10.1269/jrr.46.173]. In a separate forensic investigation using human blood samples, RNA-Seq analysis identified the INPP4B as an mRNA marker with expression increasingly associated with age in a U.S. dataset, and its inclusion in a lasso regression model contributed to age prediction with a mean absolute error of 4.35 years [Dørum et al. DOI:10.1016/j.fsigen.2023.102976].