Basic Information

Symbol
INPP5B
RNA class
mRNA
Alias
Inositol Polyphosphate-5-Phosphatase B Type II Inositol 1,4,5-Trisphosphate 5-Phosphatase Inositol Polyphosphate-5-Phosphatase, 75kDa Phosphoinositide 5-Phosphatase EC 3.1.3.36 5PTase 75 KDa Inositol Polyphosphate-5-Phosphatase Inositol Polyphosphate-5-Phosphatase, 75kD EC 3.1.3 OCRL2
Location (GRCh38)
1:37860696-37947077
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005540.3
Sequence length
4450.0 nt
GC content
0.4921

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1646.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1725.73 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1197.08
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001297434.2 NCBI
GAGGAGCUUGAGGAAGCAGGCAGGGAAAUGUCUGCCGCCGCCGGCUCUC… 3895 nt 0.4760
NM_001350227.2 NCBI
GAGGAGCUUGAGGAAGCAGGCAGGGAAAUGUCUGCCGCCGCCGGCUCUC… 3891 nt 0.4760
NM_001350228.1 NCBI
UAGAGACGGGGUUUCACCGUGUUGGCCAGGAUGGUCUCGAUCUCCUGAC… 4343 nt 0.4796
NM_001365820.1 NCBI
GAUGCAAUGGGCCUGCUGGGGCGGGGGUGAAGGGCAAGCAGCAAUGGGA… 4482 nt 0.4915
NM_001365821.1 NCBI
AAAUGUAGUCACUGUCCCGGAACCUGGGGCAGCGGAGUCCCGUGCGCCC… 4448 nt 0.4915
NM_001365822.1 NCBI
GAUGCAAUGGGCCUGCUGGGGCGGGGGUGAAGGGCAAGCAGCAAUGGGA… 4384 nt 0.4902
NM_001365823.1 NCBI
AAAUGUAGUCACUGUCCCGGAACCUGGGGCAGCGGAGUCCCGUGCGCCC… 4633 nt 0.4934
NM_001365824.1 NCBI
AAAUGUAGUCACUGUCCCGGAACCUGGGGCAGCGGAGUCCCGUGCGCCC… 4636 nt 0.4933
NM_001365825.1 NCBI
AAAUGUAGUCACUGUCCCGGAACCUGGGGCAGCGGAGUCCCGUGCGCCC… 4356 nt 0.4904
NM_005540.3 NCBI
GUAGUCACUGUCCCGGAACCUGGGGCAGCGGAGUCCCGUGCGCCCUGUG… 4450 nt 0.4921
Summary

This gene encodes a member of a family of inositol polyphosphate-5-phosphatases. These enzymes function in the regulation of calcium signaling by inactivating inositol phosphates. The encoded protein is localized to the cytosol and mitochondria, and associates with membranes through an isoprenyl modification near the C-terminus. Alternatively spliced transcript variants of this gene have been described. [provided by RefSeq, Jul 2014]

Forensic Context

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