Basic Information
Symbol
INSIG1
RNA class
mRNA
Alias
Insulin Induced Gene 1
Insulin-Induced Gene 1 Protein
INSIG-1 Membrane Protein
MGC1405
CL-6
INSIG-1
CL6
Location (GRCh38)
7:155296731-155311963
Forensic tag(s)
Chronological age estimation
MANE select
Transcript ID
NM_005542.6
Sequence length
2908.0 nt
GC content
0.4481
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-911.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-966.11 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
703.34
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| GCGGCCGUCCCGGGCCGUGACUCCUCCUUUCCCCCGCCCCGCCUCCGUU… | 2979 nt | 0.4471 | |
| GCGGCCGUCCCGGGCCGUGACUCCUCCUUUCCCCCGCCCCGCCUCCGUU… | 3047 nt | 0.4542 | |
| GCGGCCGUCCCGGGCCGUGACUCCUCCUUUCCCCCGCCCCGCCUCCGUU… | 2976 nt | 0.4553 | |
| GCGGCCGUCCCGGGCCGUGACUCCUCCUUUCCCCCGCCCCGCCUCCGUU… | 2684 nt | 0.4527 | |
| GCGGCCGUCCCGGGCCGUGACUCCUCCUUUCCCCCGCCCCGCCUCCGUU… | 2938 nt | 0.4476 | |
| GCGGCCGUCCCGGGCCGUGACUCCUCCUUUCCCCCGCCCCGCCUCCGUU… | 2908 nt | 0.4481 | |
| GCGGCCGUCCCGGGCCGUGACUCCUCCUUUCCCCCGCCCCGCCUCCGUU… | 2523 nt | 0.4138 | |
| GCGGCCGUCCCGGGCCGUGACUCCUCCUUUCCCCCGCCCCGCCUCCGUU… | 2616 nt | 0.4446 |
Summary
This gene encodes an endoplasmic reticulum membrane protein that regulates cholesterol metabolism, lipogenesis, and glucose homeostasis. The encoded protein has six transmembrane helices which contain an effector protein binding site. It binds the sterol-sensing domains of sterol regulatory element-binding protein (SREBP) cleavage-activating protein (SCAP) and 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase (HMG-CoA reductase), and is essential for the sterol-mediated trafficking of these two proteins. It promotes the endoplasmic reticulum retention of SCAP and the ubiquitin-mediated degradation of HMG-CoA reductase. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Oct 2016]
Forensic Context
A study in human menstrual blood-derived stem cells (MenSCs) demonstrated that the INSIG1 (INSIG1), a gene involved in lipid and cholesterol metabolism, was down-regulated with increasing donor age [Chen et al. DOI:PMC4713568]. This differential expression was identified via whole human genome microarray analysis as part of a panel of key genes associated with cellular aging, providing a theoretical base for clinical cellular therapy.