Basic Information

Symbol
ANKRD12
RNA class
mRNA
Alias
Ankyrin Repeat Domain 12 KIAA0874 ANCO-2 GAC-1 Ankyrin Repeat Domain-Containing Protein 12 Ankyrin Repeats Containing Cofactor 2 Ankyrin Repeat-Containing Cofactor 2 FLJ20053 GAC-1 Protein Nbla00144 ANCO1 ANCO2
Location (GRCh38)
18:9136228-9285985
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_015208.5
Sequence length
11284.0 nt
GC content
0.3557

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2583.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2808.17 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 3007.10
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001083625.3 NCBI
GCGGGGCGACGCUGUCCUGGGAGCGAGGAGGCUGUGGUGAGAGACGGAC… 11215 nt 0.3554
NM_001204056.1 NCBI
CGGCCGCUCGGGCCGGGAGCGUCGGAGGUACCCGGGUCCUGGGAGAGGU… 11358 nt 0.3538
NM_015208.5 NCBI
GCGGGGCGACGCUGUCCUGGGAGCGAGGAGGCUGUGGUGAGAGACGGAC… 11284 nt 0.3557
Summary

This gene encodes a member of the ankyrin repeats-containing cofactor family. These proteins may inhibit the transcriptional activity of nuclear receptors through the recruitment of histone deacetylases. The encoded protein interacts with p160 coactivators and also represses transcription mediated by the coactivator alteration/deficiency in activation 3 (ADA3). Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Feb 2011]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.