Basic Information

Symbol
IRAK2
RNA class
mRNA
Alias
Interleukin 1 Receptor Associated Kinase 2 Interleukin-1 Receptor-Associated Kinase-Like 2 IRAK-2
Location (GRCh38)
3:10164863-10243756
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001570.4
Sequence length
3431.0 nt
GC content
0.5150

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1226.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1289.63 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 875.34
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001570.4 NCBI
AGUCGUCCCGCGCCGGAGCCGGCCCCGUAGCGUGCCAUGGCCUGCUACA… 3431 nt 0.5150
Summary

IRAK2 encodes the interleukin-1 receptor-associated kinase 2, one of two putative serine/threonine kinases that become associated with the interleukin-1 receptor (IL1R) upon stimulation. IRAK2 is reported to participate in the IL1-induced upregulation of NF-kappaB. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the IRAK2 is a gene/protein marker indicating high severity and poor outcome in lethal E. coli-induced sepsis, with its highest expression observed in the late-stage lethal infection group [Zhang et al. DOI:10.1093/jimmun/vkaf140]. A study in rats demonstrated that the IRAK2 gene, identified as an inflammatory response gene, was upregulated in the cerebral cortex at 6 hours (2.82-fold) and 12 hours (2.14-fold) following a moderate fluid percussion traumatic brain injury, with its expression profile closely associated with the subsequent progression of apoptotic cell death [Shojo et al. DOI:10.1016/j.neuroscience.2010.10.018].