Basic Information

Symbol
IRAK4
RNA class
mRNA
Alias
Interleukin 1 Receptor Associated Kinase 4 NY-REN-64 Interleukin-1 Receptor-Associated Kinase 4 Renal Carcinoma Antigen NY-REN-64 EC 2.7.11.1 IRAK-4 EC 2.7.11 IMD67 REN64 IPD1
Location (GRCh38)
12:43758944-43798307
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_016123.4
Sequence length
4284.0 nt
GC content
0.4213

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1475.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1547.85 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 839.39
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001114182.3 NCBI
CUUCGCGGCGCUUCCUAGUUCGGCUGGUUCUUCUGUCGCCGGCUUCAGC… 4332 nt 0.4215
NM_001145256.2 NCBI
CUUCGCGGCGCUUCCUAGUUCGGCUGGUUCUUCUGUCGCCGGCUUCAGC… 4186 nt 0.4219
NM_001145257.2 NCBI
CUUCGCGGCGCUUCCUAGUUCGGCUGGUUCUUCUGUCGCCGGCUUCAGC… 4138 nt 0.4217
NM_001145258.2 NCBI
CUUCGCGGCGCUUCCUAGUUCGGCUGGUUCUUCUGUCGCCGGCUUCAGC… 3968 nt 0.4239
NM_001351338.2 NCBI
CUUCGCGGCGCUUCCUAGUUCGGCUGGUUCUUCUGUCGCCGGCUUCAGC… 4762 nt 0.4378
NM_001351339.2 NCBI
CUUCGCGGCGCUUCCUAGUUCGGCUGGUUCUUCUGUCGCCGGCUUCAGC… 4399 nt 0.4233
NM_001351340.2 NCBI
CUUCGCGGCGCUUCCUAGUUCGGCUGGUUCUUCUGUCGCCGGCUUCAGC… 4351 nt 0.4231
NM_001351341.2 NCBI
CUUCGCGGCGCUUCCUAGUUCGGCUGGUUCUUCUGUCGCCGGCUUCAGC… 4535 nt 0.4284
NM_001351342.2 NCBI
CUUCGCGGCGCUUCCUAGUUCGGCUGGUUCUUCUGUCGCCGGCUUCAGC… 4181 nt 0.4253
NM_001351343.2 NCBI
CUUCGCGGCGCUUCCUAGUUCGGCUGGUUCUUCUGUCGCCGGCUUCAGC… 4236 nt 0.4278
Showing 1 to 10 of 13 entries
Summary

This gene encodes a kinase that activates NF-kappaB in both the Toll-like receptor (TLR) and T-cell receptor (TCR) signaling pathways. The protein is essential for most innate immune responses. Mutations in this gene result in IRAK4 deficiency and recurrent invasive pneumococcal disease. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2011]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the IRAK4 gene was upregulated in the prefrontal cortex and hippocampus as part of Toll-like receptor signalling in sepsis [Pinheiro da Silva et al. DOI:10.1111/jcmm.17938].