Basic Information

Symbol
IRAK4
RNA class
mRNA
Alias
Interleukin 1 Receptor Associated Kinase 4 NY-REN-64 Interleukin-1 Receptor-Associated Kinase 4 Renal Carcinoma Antigen NY-REN-64 EC 2.7.11.1 IRAK-4 EC 2.7.11 IMD67 REN64 IPD1
Location (GRCh38)
12:43758944-43798307
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_016123.4
Sequence length
4284.0 nt
GC content
0.4213

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1475.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1547.85 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 839.39
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001351344.2 NCBI
CUUCGCGGCGCUUCCUAGUUCGGCUGGUUCUUCUGUCGCCGGCUUCAGC… 4052 nt 0.4220
NM_001351345.2 NCBI
CUUCGCGGCGCUUCCUAGUUCGGCUGGUUCUUCUGUCGCCGGCUUCAGC… 4516 nt 0.4269
NM_016123.4 NCBI
CUUCGCGGCGCUUCCUAGUUCGGCUGGUUCUUCUGUCGCCGGCUUCAGC… 4284 nt 0.4213
Showing 11 to 13 of 13 entries
Summary

This gene encodes a kinase that activates NF-kappaB in both the Toll-like receptor (TLR) and T-cell receptor (TCR) signaling pathways. The protein is essential for most innate immune responses. Mutations in this gene result in IRAK4 deficiency and recurrent invasive pneumococcal disease. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2011]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the IRAK4 gene was upregulated in the prefrontal cortex and hippocampus as part of Toll-like receptor signalling in sepsis [Pinheiro da Silva et al. DOI:10.1111/jcmm.17938].