Basic Information

Symbol
IREB2
RNA class
mRNA
Alias
Iron Responsive Element Binding Protein 2 IRP2 Iron-Responsive Element-Binding Protein 2 Iron Regulatory Protein 2 IRE-BP 2 EC 4.2.1.3 IRE-BP2 IRP2AD NDCAMA ACO3
Location (GRCh38)
15:78437431-78501453
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004136.4
Sequence length
6324.0 nt
GC content
0.3820

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1654.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1782.75 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1231.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001320941.2 NCBI
GAGCCUGCUUCCUUCUUUCCUCCCUUGCCAGUCCGCCUGUCUUCCUCCC… 6254 nt 0.3823
NM_001320942.2 NCBI
CCUUGCUUUUCUCGCCUGGAGUCGCUCGGCAGGCGCCCAGGCCCUCGGG… 6619 nt 0.3966
NM_001320943.2 NCBI
GAGCCUGCUUCCUUCUUUCCUCCCUUGCCAGUCCGCCUGUCUUCCUCCC… 4464 nt 0.3902
NM_001354994.2 NCBI
AAUGGGAGAGAACCAGUCAAGAUUGAGAUAUGUGAGAUUAGAAAGUGGA… 6474 nt 0.3821
NM_004136.4 NCBI
GAGCCUGCUUCCUUCUUUCCUCCCUUGCCAGUCCGCCUGUCUUCCUCCC… 6324 nt 0.3820
Summary

The protein encoded by this gene is an RNA-binding protein that acts to regulate iron levels in the cells by regulating the translation and stability of mRNAs that affect iron homeostasis under conditions when iron is depleted. When iron levels are low, this protein binds to iron-responsive elements (IRES), stem-loop structures located either in the 5' or 3' UTRs. Binding to the 5' UTR represses translation, while binding to the 3' UTR inhibits mRNA degradation. When iron is found in the cell, this protein is degraded in a F-box and leucine rich repeat protein 5-dependent manner. Variants in this gene have been associated with lung cancer and chronic obstructive pulmonary disease (COPD). Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Aug 2017]

Forensic Context

A study in mice and human cell lines demonstrated that ethanol metabolism-mediated oxidative stress down-regulates hepcidin transcription via C/EBPα, leading to increased duodenal iron transporter expression [Harrison-Findik et al. DOI:10.1074/Jbc.M602098200]. In human neuroblastoma cells, manganese exposure significantly decreased the IREB2 to 9.05% of control levels, indicating its role in cellular responses to metal toxicity [Cahill et al. DOI:10.3390/Biom14060647].