Basic Information

Symbol
IRF2
RNA class
mRNA
Alias
Interferon Regulatory Factor 2 IRF-2
Location (GRCh38)
4:184385702-184474558
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002199.4
Sequence length
2257.0 nt
GC content
0.4524

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-606.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -651.02 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 643.92
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_002199.4 NCBI
CUCUCCUUGUUUUGCUUUCGAUCUGGACUGUUCUCAGGCAAGCCGGGGA… 2257 nt 0.4524
Summary

IRF2 encodes interferon regulatory factor 2, a member of the interferon regulatory transcription factor (IRF) family. IRF2 competitively inhibits the IRF1-mediated transcriptional activation of interferons alpha and beta, and presumably other genes that employ IRF1 for transcription activation. However, IRF2 also functions as a transcriptional activator of histone H4. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly upregulated the transcription factor IRF2 in cortical astrocytes, as identified through single-cell RNA sequencing analysis [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649].