Basic Information

Symbol
IRF2BPL
RNA class
mRNA
Alias
Interferon Regulatory Factor 2 Binding Protein Like EAP1 KIAA1865 C14orf4 Probable E3 Ubiquitin-Protein Ligase IRF2BPL Enhanced At Puberty Protein 1 Enhanced At Puberty 1 Interferon Regulatory Factor 2 Binding Protein-Like Interferon Regulatory Factor 2-Binding Protein-Like E3 Ubiquitin-Protein Ligase IRF2BPL Chromosome 14 Open Reading Frame 4 EC 2.3.2.27 NEDAMSS
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference

MANE select

Transcript ID
NM_024496.4
Sequence length
4166.0 nt
GC content
0.6284

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1865.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1934.54 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 965.79
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.((((((..((((..(((((((((((.(((......))).)))((((((.((.(.((..........)).).)).))))))...(((((..((...((((((..(((.......(((.((((((((((((((((.((((.(.((.......))).)))))))..((.(((((((((((((.((.((((.(.((((((((((((.(..(((((((((((((..((.(((((((((((......((((((((....))).(((((((((((((.......((((....))))))))))))).........))))))))).))))))))))).))((((((((((((.((((((((....(((.(((((((..(.(((((....)))))..)..))..))))).)))....)))))))))))).(((.(.(((((((......))))))).)..)))))))))))..((((((.(((((.((((((.......))..).)))..)))))..))))))..)))))))((((......(((((((((((...((((...(((.((...)).))).....)))))))))))))))(((.(..((((((((...(((....((((......)))).....)))....))))))))..).))).((..(((((((.((((((((.((((((((.(((((..((((((.(((((((((((.(.((((((..(((.....)))....)))))).).)))))))))....)).)))..((((((...)))))))))..)))))))))))))))))))....(((((((..((((.((..((((.(.((..(((..(((((...)))))...))))).).))))..)).))))))))))).........(((((((((((((...)))).((((.(((((.....((((.(.((((.((....)))).)).).))))))))).)))).)))))))))......((((((....))))))........)).)))))))..))........((((((((.(((.((((......)))))))..)))))).)).))))..))))))...).)))))))))))).)))))))...))))))))))))).))(((.((((((((......)))))))).)))........((((((((((((((((((((.((((.((((((((.((((((.((((....))....((....)).((.((.((.((.((....)).)).)).)).)).((.((....)).)).......(((.(((((......)))))..)))..))..)))))).))))))))))))..(((((((....))).)))).....))))))))))))))))))))((.(((((((((((((((((...((((....))))...........))))))).((((.(((((((.((..((.((......))))..)).))))..))).(((((((((.....))).))))))......)))).(((((((((......(..((((....))))..).....))))))))))))))))))).))))))))))))))).)))...((((((((((((((....(((.((.((((.(((...)))))).).)).)))))))))))))))))..)))..))))))...))..)))))))))..)))).))))..))))))(((..(((...(((((..(..(((((((((...(((.(((.((((((((((.((..((.((((((((....))))))))....))..)).)))))))..)))))).)))..(((..(((.(((.....))).)))..)))((((((..(((...)))))))))))))))))).)..)))))...)))..)))(((((....)))))........((((.(.((((((..((((((((.(((...)))..((((((((((((((((.......)))..((((....))))((((((((((.((((((.((...((.(((((((((.((..(((((......)))))..))..))).....((((....)))).....)))))))).)))))))).)))).))))))((((((((...)))(((.((((((...(((..(((..(.((((....)))).)..)))..))))))))).)))....(((((.(((.(((((((((.(.......).)))))))))..))).))))))))))...)))))))))))))....((((((.......)))))).............((((((((.(((((((.(((.((.....)).).)).).)))))).))))))))))))))))((((((((..(((((((((..((((((..((..(((((((.(((((.(((((....(((..(((((((..(((((..(((........)))((((.....))))..((((((...))))))(((((((((.((.((((((.((((((((((((((((.(....).))))))........(((.((....)))))))))).)....)))).)))))).))..))..)))))))...))))).)))))))..))))))))..)))).)..))).))))..))....))))))))))(((.(((..((((((..(((((..((((((((((.....)))))))))).((((....)))).......(((....))).....(((((((..((((..(((((((.(((.((((.....))))))).))).(((((((((((........(((((...........))))).(((..(((......)))..)))....((((.((((((((((((.((.((....))...)).)))))((...))))))))).)))).))))).))))))........))))..)))).....))))))).)))))))))))..))).)))....((((((((((.((((((..(((((((.(.(((.((......)).((((.(((((((((....))))))).....)).)))).))).)))))).))....)))))).))))).)))))...((((((((((........((((.....(((((((.......((((.(((((((((((.((..(((((.(((.(((((.((((...)).).).)))))..))).))))).......)).))))))))))).)))))))))))....))))........))))))))))....((((...((((........))))....)))))))))..).)))))))..........))))))).))))......((((...))))))))............(((((((((((..(((((((...............(((((.((((((((.((((((.....((((.......))))...............((((((........))))))(((((.....(((((..((((((..((....((((.((......)).)))).((((.((((..(((...(((.((((((.....((((((((.(((((((((((..((((.((..(((...............)))..)))))).)))))))).((((((.(((((..........................))))).)))))).............((((((((((((((((((((((((....((((.(((...)))))))....)))))))))))))))))))))))).))).))))))))....)))))))))...)))..)))))))))).))))))..)))))....))))).)))))).)))))))).)))))..((((((((....))))))))...)))))))..)))))))).)))......(((((((((((((..(((((((..........((((.((....)).))))..(((((((.((((..(((((((((.....(((((((((((((((..(((....))).......))))))))))))).))..))))))(((......))))))..))))...)))))))(((((.....))))).(((......)))))).....))))..)))))))))))))...............
Thermodynamic Ensemble Prediction
,{{,.((((((..((((..(((((((({((.((({.....}))})}}((((((.((.(.((..........}).}.)).)))))),..{((((..((...((((((..(((.......(((.((((((((((((((((.((((.{.{{.......)}).)))))))..((.(((((((((((((.(.(((((..((,(((((((((,(((((.,((((,,,,||}},..|||||||||||}}}}}.}}((((((((((((((,(((((((((,(({(({{{{((((....}}}}.|{{|||||,.......}))}})))|{{|||||||||||..|((((((((((((.((((((((....(((.((((({(..{.(((((....)))))..)..)}..))))).)))....)))))))))))).(((.(.(((((((......))))))).}..))))))))))),,((((((.((((((((((((.....,.))..,.}}}..)))))}.)))))).,},|||,,,.|{,.,,,.(((((((((((...({((,..(((.((...)).))).,,..)))})))))))))))..|}||.((((((((...(((....((((......)))).....)))....)))))))){{|{,|.,||,.,,,,|||.{.((((((.(((((((,,(((((..(((.,{.{{((((((({{,({((((((..(((.....)))....)))))).)}}))}))))},...,,.}}}..||||{{,..)))))))))..))))))))))))))))))).,}}|||||||,}|,(({((.,{|{{...|,.}||,,}|||||}}})))),}..),)))))))),,..||{|||||||||||,........((((((((((((,...,||},({((,(((((((({,((,....,)})))}...,|||..,},}}))}}))))).}})).)))))))))....,.((((((....)))))).|||||..}}|)}))}}}||||..,,.|}.||{{((((.(((.((({......}))))))..)))))),||.||,,..)).))))).).))))))))))))})))))),...))))))))))))).))(((.((((((((......)))))))).)))........((((((((((((((((((((.((((.((((((((.((((((.({((....||....||....||.((.((.((.((.((....)).)).)).)).)).||.||.}}.)).)).......(((.(((({......))))}..}))..))}.)))))).))))))))))))..(((((((....)}}.)))).....))))))))))))))))))))((.(((((((((((((((((...{(((....)))).,.......,,))))))).((((.(((((((.{(..((.((......))))..)).))))..))).(((((((((.....)))}})))))......}}}}.(((((((((......(..((((....))))..).....))))))))))))))))))).))))))))))))))).)))...((((((((((((((....(((.((.(((,{(((...)))))).).)).)))))))))))))))))..)))..))))))...))..))))))))}..)))).))))..))))))|{{..(((...(((((..{..(((((((((...(((.(((.((((((((((.((..((.((((((((....))))))))....))..)).))))))),.))}))).)))..{(({.(((.((,.....)))||)},.,}}((((({.{|,|...)),})))))))))))))).)..)))))...))),,)))(((((....))))).....(((((.((((,...(((((((.((((((.(((...,..((((((((((((((,,,.((,,,{||,.((((....)))),{{{{,((((.(((((,,((...((.(((((((((.((..(((({......)))))..))..))),,,..{{{|....)}}}..,..)))))))).)))))))).)))),))))))|{{{{{{{...|}}{((.((((((...{((..(((..,.((((....)))).)..))).,})})))))).)))...{(((((.(((.(((((((((.(.......).)))))))))..))).)))))),}))..,)))))))))))))...{{(((((.....,.|}}}}},},.,,,.{(({{((((((((.(((((((.(((.((.....)).).)).).)))))).)))))))),})))))|((((((((,.(((((((((..((((((..((..(((((((.(((((.(((({...,(((..(((((((..(((((..(((.....,..}||((((...,.||}}..((((((,,.||||||(((({(((({((.(({{{{.{||||{{||{((((((.(....).)))))).......,|||}||.}}}),,,)))))).}....)))},))))))})}..))..)))))))...))))).)))))))..))))))))..)))).)..))).))))..))....))))))))))(((.(((..((((((..(((((..((((((((((.....)))))))))).((((....)))).......(((....))).....(((((((,,((((..(((((((.(((.((((.....))))))).))).(((((((((((.,....,,(((((...{.....,.))))}.|{{,,(({,,...{}|}..,,}.,..||||,|{((({((((((.((.((....))...)).)))))||},.,,))))))),))}).))))),,)))))........))))..)))).....))))))).)))))))))))..))).)))....((((((((((.((((((.,({((((({(.(((.((.....,},.((({.{{(((((((....))))))).....}}.)))}.))).)))))).))....)))))).))))}.)))))...((((((((((........(((({(((((((((((....},,{,{{.(((((((((((,(({.(((((.,((.(((({.{{({...)).}.,.,)))).,))}.)))))},,....}..))))))))))).}})))))).))}...))))........))))))))))....((((...((((........))))....))))))))),,}.))))))).,...((((((((({((((.........))))}((((((,..,(((.((((...((((((((((((..(((((((.......,,,,....(((((.((((((((.((((((,,,..((((.......))))........,{{{.{.((((((........)))))).|,|,}}}..(((((..((((((..({....((((.((......)).)))).{(((.((((..(((...(((.((((((.....((((((((.,{{((((((((..(({((((..(((.............,.)))..)))))}.))))))))|((((((.(((((,{,...,...,,},..........})))),),)))),}.............((((((((((((((((((((((((....((({,(((...)))))))...,)))))))))))))))))))))))}.,,,.))))))))....)))))))))...)))..)))))))),}.))))))..)))))....)))},.}))))).)))))))).))))),.{{((((((....)))))))).,,)))))))..)))))))).}))}}.......))))...)}}.).))))))...((((((.((((.((....)).)))).))))))))))).))))..{(((((,,,..({(((((((((((((..{({....,}}.,.....))))))))))))).}}..))))))}.,....))).)))))).)))))))((((.((((((.....))))))...)))).,)))))))))..,,,.....,,...........,........,,..

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GGGGACAGCGCGAGCCGCAGCCGGAGCAGGAGCGCCGAGACGCGCCUCC… 4166 nt 0.6284
Summary

This gene encodes a transcription factor that may play a role in regulating female reproductive function. [provided by RefSeq, Jun 2012]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the IRF2BPL transcript, a neuroendocrine reproduction regulator, increased in abundance at 1 hour postmortem [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267].