Basic Information
Symbol
IRF8
RNA class
mRNA
Alias
Interferon Regulatory Factor 8
IRF-8
ICSBP
ICSBP1
Interferon Consensus Sequence Binding Protein 1
H-ICSBP
Interferon Consensus Sequence-Binding Protein
IMD32A
IMD32B
Location (GRCh38)
16:85899116-85922606
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
Wound age identification
MANE select
Transcript ID
NM_002163.4
Sequence length
2668.0 nt
GC content
0.4929
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-912.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-964.35 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
747.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| GUGAGGUCAUGGAGGCCAGCAUUGCCUUCUCAUGGCAGGUGUCCCGGAG… | 2669 nt | 0.4882 | |
| GAUGUGUGACCGGAAUGGUGGUCGGCGGCUUCGACAGUGGCUGAUCGAG… | 2503 nt | 0.4802 | |
| GCCUGGAGCGCGGCAGCAAGCGUGGGAACGCGGGCGGCGAGACGGCGGC… | 2668 nt | 0.4929 |
Summary
Interferon consensus sequence-binding protein (ICSBP) is a transcription factor of the interferon (IFN) regulatory factor (IRF) family. Proteins of this family are composed of a conserved DNA-binding domain in the N-terminal region and a divergent C-terminal region that serves as the regulatory domain. The IRF family proteins bind to the IFN-stimulated response element (ISRE) and regulate expression of genes stimulated by type I IFNs, namely IFN-alpha and IFN-beta. IRF family proteins also control expression of IFN-alpha and IFN-beta-regulated genes that are induced by viral infection. [provided by RefSeq, Jul 2008] CIViC Summary for IRF8 Gene
Forensic Context
A study in mice demonstrated that following clodronate liposome pre-treatment and controlled cortical impact brain injury, monocytes emerging from emergency monopoiesis exhibited a transcriptional profile indicative of immaturity, characterized by higher expression of the IRF8 in bone marrow monocytes compared to bone marrow-derived macrophages [Gudenschwager Basso et al. DOI:10.1186/s12974-024-03032-8]. A study in porcine skin exposed to bromine vapor demonstrated that the IRF8 was significantly upregulated approximately 2.9-fold in both 10- and 20-minute exposure groups at 48 hours postexposure, as identified via microarray analysis and pathway analysis [Rogers et al. DOI:10.1002/jbt.20383].