Basic Information

Symbol
IRF9
RNA class
mRNA
Alias
Interferon Regulatory Factor 9 ISGF3G Interferon-Stimulated Transcription Factor 3, Gamma (48kD) Interferon-Stimulated Transcription Factor 3, Gamma 48kDa IFN-Alpha-Responsive Transcription Factor Subunit Transcriptional Regulator ISGF3 Subunit Gamma Interferon-Stimulated Gene Factor 3 Gamma ISGF3 P48 Subunit ISGF-3 Gamma IRF-9 ISGF3 P48
Location (GRCh38)
14:24161101-24168043
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006084.5
Sequence length
1626.0 nt
GC content
0.5474

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-605.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -635.33 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 441.07
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001385400.1 NCBI
GGAGAGAUCAGCCGCCCAGCCAGGAGUUAAGCUGAGGUCGUCUGAGCCC… 1780 nt 0.5489
NM_001385401.1 NCBI
GGAGAGAUCAGCCGCCCAGCCAGGAGUUAAGCUGAGGUCGUCUGAGCCC… 1653 nt 0.5481
NM_001385402.1 NCBI
GGAGAGAUCAGCCGCCCAGCCAGGAGUUAAGCUGAGGUCGUCUGAGCCC… 1363 nt 0.5282
NM_006084.5 NCBI
GGAGAGAUCAGCCGCCCAGCCAGGAGUUAAGCUGAGGUCGUCUGAGCCC… 1626 nt 0.5474
Summary

This gene encodes a member of the interferon regulatory factor (IRF) family, a group of transcription factors with diverse roles, including virus-mediated activation of interferon, and modulation of cell growth, differentiation, apoptosis, and immune system activity. Members of the IRF family are characterized by a conserved N-terminal DNA-binding domain containing tryptophan (W) repeats. Mutations in this gene result in Immunodeficiency 65. [provided by RefSeq, Jul 2020]

Forensic Context

A study in humans and mice demonstrated that the IRF9 was identified as a diagnostic and prognostic hub gene in sepsis [Sun et al. DOI:10.3389/fgene.2024.1389630].