Basic Information

Symbol
IRS1
RNA class
mRNA
Alias
Insulin Receptor Substrate 1 HIRS-1 IRS-1
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis

MANE select

Transcript ID
NM_005544.3
Sequence length
9771.0 nt
GC content
0.5077

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3538.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: 100000.00 kcal/mol
Frequency: inf
Diversity: 0.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((.((.((((((((((.((((......(((((....(((((.(((....))).)))))))))))))).)))).((((((((((.((.((.(.((((((((.(.(((......))).).)))((((((.......)))))).(((((.(((((.((((((.((((((......((((....))))(((((((...)))...)))).............))))))...)))))))).)))))))).....(((((((..((((((((((..........)))).))))))..)))))))))))).).)).)))))))))))).(((((.((.((((((((((.(((((((((.((((((((...)))).))))...).))))))))))).....(.((((.((.......)))))).)))))))).)).))))).((.((....)).)).((....))..))))))..))))))).(((((((((((((.((((.(.((((((.((((((((..(((((((.((.((((((((((((.((((((...(((((((((((((....((((......((((((((((((...(((((((((..(((.(((..(......)..))).))).(((((((((((((..((((.......((((.(((((((((((....))))))((.((((((((((..(((((((((((.((((((((((.(((((((((((...((((..(((((((.((........)).)))))))...)))).((.((.(((((((((.(((((((.(((((..(((((..((((((((....(((((((((.((...........))))))).))))))).)))))...)))))((.((((((......)))))).))))))).)).)))))))))))))))).)))))))))))))))))))...........)))))))))))))))))))).((((((.(((((...((((((((((((((.(.((((.(((((.....((......)).....))))).))))).))))(((((.(((.((((.((((((((.((...(((.((..(((((.((((....)))).))))).)).)))...))..)))))).(((((...(.((((((..........)).)))).)...))))))).)))).))).))))).))))))))))..((((.......))))........((((((((....(((((((((((........))))))).....))))...))))))))........))))))))))).))))).)).........((((((((((((((.(((((((.(((((....((((((((((.(((((..(((((((.(((.(...((((((..(((((..................((((.((.((((((.(..(......)..).)))))).)).))))(((((((((((((((((((.((((((..((((((((((...))))))))))..).))...))).))))....))))))).((((((.........).)))))......((((((....(((....)))..)))))).....((((((.....))).))))))))))).))))))))))).......(((((((....)))))))....(((((.((((((.(((((((((((((...(((...)))...)))))))).....((((......)))).......(((((((.((((((..(((..(((((((((((.((.((((.((((((.(((((.((..((((.((.........(((.((((((((((((.(.((((.....)))).).)).)))).))......))))..)))(((((.(((.........))))))))..)))))).))))))).)))))))))).)).............(((((((......))))))).......((((.((...(((((((.((......(((........)))........(((((((((...((((..(((((..((((.((.......))))))..)))))..)).))))))))))))))))))))))))))..))))).).)))))..)))...))))))....)))))))(((...((((((((.....))))).)))...)))..))))).)))))))).))).).))))))))))(((((((((...(((((((((...(((((.(((((.(((.(((((((((((..((((((((....(((((((((((.(.((((((((((.(((..((.(((....(((((..((....(((((.((..((.(((((((((....))))))).)).))(((((...))).))..((((((((.(((.....)).)..)))))))).)).)))))))))))).))).))..))).))).))))))))...(((........)))..((((((..(((...)))))))))((((((.......)))))).........))).))))))))..)))))))).(((((.((((((....(((((.((((....)))))))))...)))))).....)))))..))))))).....((((........))))...(((......)))((((((((((((.....................(((...)))..(.((((((((((...)))))))))).).......)))).))))))))...(((((....)))))...))))))).)))))))))).....(((((.........))))).......((((......))))((((((((.....((((((((((((((((.(((.((......)).))).))).))))))..........((((...(((.....)))...))))..)))))))...)))).)))).))))))))).)))))))))......(((((.(.((.....)).).)))))(((((......)))))..........(((((...(((((..(((.....)))......)))))....))))).))))).)).))))))))))))))))......(((.((...)))))((.((.((....)).)).))......(((((....)))))(((((......)))))........)))))))))))))))))).......))))).)))).........))))..)))).)))))))))(((((....)))))....((.((((((...........)))))).))))))))..........((((((......).))))).....)))...((((((.....((....))..))))))............)))))))).))))....))))..((((.((...((((((.((((((..(((((...)))))....)))))).))))))....)).))))......((....(((((...)))))...)))))))))))))))....(((((((..(((((((((((((....((.(((...(((((((...)))))))))).))))))))))....((((..(((((....(((((((....)))))))....)))))...)))).(((((...((((((((((((..(..((((.((.((((....)))).)).))))..).......((((((((((((.(((((((..((....))..)))))))......((((.........((((((..(((((....)))))...)))))).........))))))).))))...)))))(((((((......))).))))......((((..((((((.(((((((.((((((((((.....))..))).))))).....)))))...))..)))))))))))))))))))))).(((((((.(((((((.(..(((..((.((..(((((((.(.((((((.((((.((....(((.((((........)))).)))....)))))).))))))).)))(((((((((.(((..........)))))))))))))))).)).))..)))..).))).)))))))))))......)))))((......))...))))).))))))).((((((((.(((..(((..((....))..))).)))))))))))..((((((((((((((((...(((....))).(((((((((.((((((((((((((((.((.(((((((((((....((((....(..((.((((((((....(((..((((((((((.......(((((....(((.......)))...)).)))(((.((..((((....))))))))).((((......))))((((...)))).....(((...))).)))))))))))))......)))))))).))..)..))))..))))).)))))))))))))).((.((....)).))..((.(((...))))).)))))))))))))))))))...((.((((((...(((((((.((((....)))))))).)))...)))))).)).))).)))))))))))))((((((((..((((....))))....((((.......)))).....))))))))..(((..(((((........)))))...))))))))))))))))))....((((((.......(((((.((((((.(((...))))).)))).))))).))))))...))).)))))).)))..))))))))))))))).)))))))(((((((.(((((((...(((((.........(((((....(((((..(((.((((((...(((((((((((.(((.(((....)))....((((....(((((.(((((((.((((((..(((((((((((.((.(((((..((((..((..((((((((((..(((((((((...((((........))))((((.....))))..(((((........)))))...................(((((((...((((.....(((((((.........................))))))).)))).)))))))(((((((((((((((((..(((((.((((((((.....)).)))))).((((((((((..((((((((((.(....).))))).)))))....((((((.....(((.((.(((((.((((....((.(((((.....))))).)).)))).))))).)).)))...)))))).......................))))))))))...((((((.((((((((((.......)))))))......((((((....(((((((((......))))))))).))))))..((((.((((((......((((((((((......)))))))))).......(((((((....(.((((((.((.......(((.((.(((((((((.(((.((((....)))).)))..)).)))))))..)).)))......)).)))))).)))))))).((((((.(((..((((........).)))..))).))))))....)))))).)))).......))))))))))))))...))).)))))........))))))))).......((((..(((((((((((.........................).)))))))).))..)))))))))))))..))))))))))..)).((((.((((((.......)))))).))))......((((((((.((.....)).))))))))...............))))..))))).))((((.(((((((.(((((((.((((.(((.(((((..(((.....((((..((((.((((((((((((.(((((......((((......))))....)))))......))))))))))))..)).))..))))....)))...)))))............(((((.(((((......((((((......)).))))........))))).)))))....(((((.......)))))..(((((((((((((((.........))))).....(((((((......)))))))((((((((((.((((....(((.....))).(((.((.((..((((........))))..)))))))..((((((.(((...(((((((((((...((((....((((((......))))))....(((((...((((....)))))))))..........(((((((..(........)..)))))))...(((((....)))))(((.(((((((....))))...))).))).(((((..((........((((((((.(.......).))))))))............))..)))))....(((((((.((.(((((((..........))))))).))..(((..((((((.....)))))).))).......)))))))((((((((.(((((.((..((((...)))))))))))..((((((((((((((....(((((((.((((((((((...((((((..((((((....(((((((((.(((((..((((((((((((.....)))..)))))))))..)))))))).....)))).))..))))))..(((((((.......))))))).((((.(((..(((..........(((.(((.(((..((((....(((..(((((..(((((..((..............((((.((((((((((............(((((((((.(((...(((((((.((((((((....)))))))).)))))))(((((...)))))....))).)))))))))..............))).)))))))))))((((((((((........))))))))))..(((.(((.(((....(((...((....))....)))....))).)))))).))..)))))..))))))))...))))..))).)))..)))((((.........))))....(((....))).((((((.((....)).))))))...))))))))))((((((.((.(((.((((....))))))).)).))))))...)))))).)))))))))).))..(((.((((...(((...)))..)))).)))(((((((((......((((.(((((((((((....)))))))..)))).))))..))))))))).)))))..)))))))....)))))))))))))))....((((((....))))))))))...))).)))))).))....)))))))))(((......)))(((.(((.......))).)))....)))).))))))))))..(((((((((......((((((......))))))(((((((((((...((((((((((.((((((((((.(..(((..(((((....((((((....)))))).....(((((((.((((((..((((((...))))))........)))))).)))))))((((.....))))(((((((.........)))).)))...(((((((((..(((((....(((((.((((((......))).))).))))).((((((((((..((((((((....))))).)))...)))))).))))...(((((((....))))))).(((((.............)))))....((((((((.((((........)))))))))))).((...........)))))))..)))))))))............)))))...)))..))))))))))).....(((((........)))))(((((((....)))))))...((((.(((((.(((..((((((...((((((.((((((.....((((.....)))))))))))))))).))))))))).)))))..))))((((((...)))).))))))))))))..((((((((((((......((..(((...(((((......))))))))..))...((((........)))))))))..)))))))((((....)))))))))))).)))........))))))))).......))))))).))).........))).)))).))).......(((......)))...))))))))))).)))))))))...)))))).....(((((((((((....))).)))))))).......))))))..))...))))).)))))..))))((((((((....((((((((((((((((((((((.(((((((((..((((((((((.(((((((((((((((((((.(((((((....(((((((((..((((.(((((((((((((((...((((.(.....).))))))))))))))))))).))))))))))))).))))))).))))))))))))))))))).))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))(((((..(((((((((((((((((....)))))))))))))))))..))))).(((.(((......((....))......))).)))(((.(((....((((((........)))))).....))).)))))))))))((((((((((..(((.((.....))..)))))).)))))))))))))))....)))))).....)))))).))))))))..))))).(((((((((((.......(((((((((((((((.((((..((....(((((....((((((((((.(((..(((((........))))).))))))).))))))...)))))....)).)))).))).))).((((((((......((..((((((((((....(((.(((.(...((((((((((.........))))))))))....).))).)))...(((((.((((.(((.((((((....))))))..)))))))))))).......((((...((((.((..((((((.......))))))((((((....(((((......))))))))))).....((((((..(((((((...(((((((......(((((((.....(((........)))...)))))))))))))).)))).)))..))))))...............(((....))))).))))...)))).((((((.((.(((.....))).))...))))))..))))))))))..)))))))))).)))))))))(((((((((((..((((((((.............))))))))..))))))))))).((((....)))))))))))))))))))))))))).((((((((....((.((((..((((.(((((((....((..(((..((((.(((...(((((((((...)))))))))...)))...))))..)))..))))))))).)))).............(((((((...)))))))...(((((((((((..(((.......((((..(((((((......((.(((...))).)).....))))))).)))).......)))....)))))))))))))))...))....)))))))).........))))))))..((((((.........))))))......................))))))))))......

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GGCGGCUGCCCGGCUGCCGAGCGCGGAGGCUCCGUCACGUGUUUUUCUC… 9771 nt 0.5077
Summary

This gene encodes a protein which is phosphorylated by insulin receptor tyrosine kinase. Mutations in this gene are associated with type II diabetes and susceptibility to insulin resistance. [provided by RefSeq, Nov 2009]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the IRS1 was mentioned in the introduction as having lower expression in males with obesity [Haltia et al. DOI:10.1002/oby.70078], while another human study investigating burn injury noted the IRS1 was mentioned in the introduction and discussion but was not experimentally studied in that paper [Knuth et al. DOI:10.1097/SLA.0000000000005880].