Basic Information

Symbol
ISG20
RNA class
mRNA
Alias
Interferon Stimulated Exonuclease Gene 20 HEM45 CD25 Promyelocytic Leukemia Nuclear Body-Associated Protein ISG20 Interferon Stimulated Exonuclease Gene 20kDa Interferon-Stimulated Gene 20 KDa Protein Estrogen-Regulated Transcript 45 Protein EC 3.1.13.1
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Wound age identification Cause of death analysis

MANE select

Transcript ID
NM_002201.6
Sequence length
1583.0 nt
GC content
0.5268

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-589.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -615.89 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 442.97
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((.((((........))))..((.(((((.((((.((((.((((......((..((((((((((...((((.(((.(.((.((((.(((((((.((((((((.((((((....(((((.....((((((((....))))))))((((...((((((((((((..(((((.(((((......))))).)))))((((...((.....))...)))).((((((.(.((((.(((...((.........))...))))))).)))))))(((.((((((.......)))))).))))).))))))))))....)))).((((((((...)))..)))))))))).)))))).))))....)))).))))))).)).)).((((((((..((((((((.(((...((((((((.(((........))))))))))).))).))))..((((..(((..((((((...(((...((((((((((.....)))))))...........)))...)))...))))))...(((((((((.(((((....(((....)))..(((((....)))))...((((...)))).....(((((.....)))))...))))).)))))))))((.((((((((...((.(((((........))).)).))))).)))))))...)))..))))...(((.(((((.(((((((.....))))))).))))).)))))))...............(((....)))))))))))......((((((((...((((((.((((((((((..((((((((........(((((((..(((((((..(..((..((((.(.....).))))))..)..)))))))))))))).........))))))))...((((.((((((....)))))).))))((((..(........)..))))..))))))))))...))))))(((...(((..(((.((((.(((((.(((((((((((((.(((..((((.(((.....)))))))..))).)))))))))..).))).)))))..))))))).)))...)))...((((((((.((((.....)))).)))))).)).((.(((((((((..((....))..))).)))...))).))..(((....)))..))))))))...((((((((.(((...((((..(((...)))..))))...((((((...(((((.....)))))....)))))).......))).))))))))...)).).))).))))..))))))))))..))...)))).))))..)))).))))))).(((((.(((((.....)))))...)))))...(((((((((.(((..(((((.........)))))..)))))))))).)).....(((((..((.((((((..((((((.(.((((.....)))).)..))))))..)))))).)).)))))(((((..(((((....).))))..))))).....(((((((....)))))))......((((((((....)))))))).......))))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
,{,.,.{{,{.,{,({(({{{{.,({,(((((.((((.((((.((({,,....((..((((((((((...(((({((,..,{,.({(((((({,,({(,,,.|||,{|||||}||.{(((({{{.,((((((((....))))))))((((...((((((((((((..(((((.{((((......))))).))))){{({...||...,,}}.,.}))),((((((.(.((((.(((...,{.{....}..}}...))))))).)))))))|((.((((((.......)))))).))))).))))))))))....)))),((((({((,,,,||,,|}}}|(((((,{,{((((.((({{{{,....)))}}))})}.)),.{(((({|||||{|((({.{{{...((((((({.(|(,.....,.}}|}))))))}.})}.|)))..((((..(({..((((({.,,{{{.,,|||(((((((.....))))))}..........,))),}})})})}))))))...(((((((((.(((((..,.(((....))}.,(((((....)))))...((((...)))).....(((((.....)))))...))))).))))))))){{.((((((((...{{.(((((........))).)).)))))}}})))}}...}))..))))..,(((.(((((.(((((((.....))))))).))))).))))}}}......}}}}}}.,,|||}},})||||||||||({{,,{(({{{(((,,.((((((.((((((((((..((((((((........(((((({,{{(((((({,,..((..((((.(.....).))))))..),,}))))))))))))).........))))))))...((((.((((((....)))))).))))((((.,(,.....,,)..))))..))))))))))...))))))(({...(((,,{((.{{,,.|||||,{{|{((((({(((.(((,,((((,(((,..,,||||}}}..))),)))))))))..|.}}}.}}}}}..|}}}))).)))..,)))...{{((((((.((((.....)))).)))))).}}.{{.{((((((((..((....))..)))}}))...))}.}}..,,,.}}}))..})))))))},}}|{,|{{{{,|{{,|||||{,,|||.,,))),.}}}}...((((((...(((((.....)))))....)))))).....,.}}}.}}}}}}}}..}))}),))).,)))..))))))))))..))...)))),))))..)))).))))))).||{{{.(((((.....)))))...}}}}}...||{((((((((((..(((((.........)))))..)))))))))),))}.,,.(((((..((.((((((..((((((,(.((((.....)))).).,))))))..)))))).)).)))))(((((..(((((....),,)))..)))))..,,.{((((({....}}))})),,....{(((((((....)))))))}....,{{{|....,))}}.

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AGACUGCAUCCCGACAUUGGUUUACAUUUCUCUUGACUGAGAAUGGUGC… 1591 nt 0.5192
AGACUGCAUCCCGACAUUGGUUUACAUUUCUCUUGACUGAGAAUGGUGC… 1717 nt 0.5201
GCAGUAGCUGAGCAGUGGCAGCAGAGAGGCAGACGUGAGCUGAGGGCGC… 3560 nt 0.5270
GCAGUAGCUGAGCAGUGGCAGCAGAGAGGCAGACGUGAGCUGAGGGCGC… 1523 nt 0.5253
GCAGUAGCUGAGCAGUGGCAGCAGAGAGGCAGACGUGAGCUGAGGGCGC… 1583 nt 0.5268
Summary

Enables 3'-5' exonuclease activity and RNA binding activity. Involved in defense response to virus; negative regulation of viral genome replication; and nucleobase-containing compound catabolic process. Located in cytoplasm and nuclear lumen. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the ISG20 is a specifically expressed core differentially expressed gene in the 12-hour group following skin and skeletal muscle wounding, where it was down-regulated and associated with wound age estimation [Zhu et al. DOI:10.1016/j.legalmed.2021.101982]. In a separate investigation of lethal and non-lethal *E. coli*-induced sepsis in mice, the ISG20 was identified as a gene/protein marker indicating the acute infection stage, expressed at higher levels in early lethal time points [Zhang et al. DOI:10.1093/jimmun/vkaf140].