Basic Information

Symbol
ISM1
RNA class
mRNA
Alias
Isthmin 1 BA149I18.1 C20orf82 Isthmin 1, Angiogenesis Inhibitor Isthmin-1 ISM Chromosome 20 Open Reading Frame 82 Isthmin 1 Homolog (Zebrafish) Isthmin 1 Homolog DJ1077I2.1 Isthmin
Location (GRCh38)
20:13221274-13300651
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_080826.2
Sequence length
3090.0 nt
GC content
0.5498

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1157.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1210.95 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 936.26
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_080826.2 NCBI
CUCCUCCUCCUCCCCGCGCUUCUCUGGCGGCCGCUCCCGCUCCAGCUGC… 3090 nt 0.5498
Summary

Predicted to be involved in negative regulation of angiogenesis. Predicted to be located in extracellular region. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A review of human studies summarizing multi-omics approaches for biological age estimation identified the ISM1 as an aging-associated transcriptome feature, where its expression was positively associated with aging in whole blood samples from a cohort of healthy people [Solovev et al. DOI:10.1016/j.mad.2019.111192].