Basic Information

Symbol
ANKRD28
RNA class
mRNA
Alias
Ankyrin Repeat Domain 28 PP6-ARS-A PITK KIAA0379 PPP1R65 CFAP79 FAP79 Serine/Threonine-Protein Phosphatase 6 Regulatory Ankyrin Repeat Subunit A Serine/Threonine-Protein Phosphatase 6 Regulatory Subunit ARS-A Phosphatase Interactor Targeting Protein HnRNP K Protein Phosphatase 6 Ankyrin Repeat Subunit A Protein Phosphatase 1, Regulatory Subunit 65 Ankyrin Repeat Domain-Containing Protein 28 Phosphatase Interactor Targeting K Protein
Location (GRCh38)
3:15667236-15859771
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001349278.2
Sequence length
7744.0 nt
GC content
0.3886

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2060.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2210.15 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2398.45
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001195098.1 NCBI
CUGUUAGUCAGCAGAGGCAGUACACCAGAUUUCCUUGUGGCUUUUAGUG… 6383 nt 0.3937
NM_001195099.2 NCBI
GUGUCUUCACAACGUUAGACCUCUCUUCAGCUGCAUUGCUGGCUGCCUA… 6070 nt 0.3947
NM_001349277.2 NCBI
AGAUCUCUGGUAAGUGUAACAUGUGAGCAUUACUAGGCAUUUCAUCCUG… 7753 nt 0.3884
NM_001349278.2 NCBI
AGAUCUCUGGUAAGUGUAACAUGUGAGCAUUACUAGGCAUUUCAUCCUG… 7744 nt 0.3886
NM_001349279.2 NCBI
AUUGUGGAGUUUGGAUGCCGCCGCUGCCGCGGGCUGGAACGGCGCGGCC… 6677 nt 0.4179
NM_001349280.1 NCBI
CUGUUAGUCAGCAGAGGCAGUACACCAGAUUUCCUUGUGGCUUUUAGUG… 6312 nt 0.3932
NM_001349281.2 NCBI
AGAUCUCUGGUAAGUGUAACAUGUGAGCAUUACUAGGCAUUUCAUCCUG… 7071 nt 0.3934
NM_001349282.2 NCBI
AGAUCUCUGGUAAGUGUAACAUGUGAGCAUUACUAGGCAUUUCAUCCUG… 7080 nt 0.3932
NM_001349283.2 NCBI
AGAUCUCUGGUAAGUGUAACAUGUGAGCAUUACUAGGCAUUUCAUCCUG… 7100 nt 0.3941
NM_001349284.2 NCBI
AGAUCUCUGGUAAGUGUAACAUGUGAGCAUUACUAGGCAUUUCAUCCUG… 1890 nt 0.3593
Showing 1 to 10 of 12 entries
Summary

Predicted to be located in cytosol and nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the ANKRD28 was identified as a hub node with differing relative connectivity between lines among ventral midbrain differentially expressed genes overexpressed in the methamphetamine high drinking line, indicating its role in the transcriptomic network associated with differential risk for voluntary methamphetamine intake [Hitzemann et al. DOI:10.3390/brainsci9070155].