Basic Information

Symbol
ITGA1
RNA class
mRNA
Alias
Integrin Subunit Alpha 1 CD49a VLA1 CD49 Antigen-Like Family Member A Laminin And Collagen Receptor Very Late Antigen-1 Integrin Alpha-1 VLA-1 Very Late Activation Protein 1 Integrin, Alpha 1 CD49a Antigen
Location (GRCh38)
5:52787916-52959209
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_181501.2
Sequence length
10736.0 nt
GC content
0.3870

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2779.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2986.42 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2786.35
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_181501.2 NCBI
ACCCGCCUUCCUACCACCUUAGGGGAUUUGGCCCGGAGAACGAGAUCAC… 10736 nt 0.3870
Summary

This gene encodes the alpha 1 subunit of integrin receptors. This protein heterodimerizes with the beta 1 subunit to form a cell-surface receptor for collagen and laminin. The heterodimeric receptor is involved in cell-cell adhesion and may play a role in inflammation and fibrosis. The alpha 1 subunit contains an inserted (I) von Willebrand factor type I domain which is thought to be involved in collagen binding. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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