Basic Information

Symbol
ITGA8
RNA class
mRNA
Alias
Integrin Subunit Alpha 8 Integrin, Alpha 8 Integrin Alpha-8
Location (GRCh38)
10:15513954-15719936
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003638.3
Sequence length
6547.0 nt
GC content
0.4430

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1945.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2076.36 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1535.07
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001291494.2 NCBI
AGACGCCGGGCACUGUCACCACGGGUGCGCCGAGCGCACCGACCCGGGA… 6502 nt 0.4425
NM_003638.3 NCBI
AGACGCCGGGCACUGUCACCACGGGUGCGCCGAGCGCACCGACCCGGGA… 6547 nt 0.4430
Summary

Integrins are heterodimeric transmembrane receptor proteins that mediate numerous cellular processes including cell adhesion, cytoskeletal rearrangement, and activation of cell signaling pathways. Integrins are composed of alpha and beta subunits. This gene encodes the alpha 8 subunit of the heterodimeric integrin alpha8beta1 protein. The encoded protein is a single-pass type 1 membrane protein that contains multiple FG-GAP repeats. This repeat is predicted to fold into a beta propeller structure. This gene regulates the recruitment of mesenchymal cells into epithelial structures, mediates cell-cell interactions, and regulates neurite outgrowth of sensory and motor neurons. The integrin alpha8beta1 protein thus plays an important role in wound-healing and organogenesis. Mutations in this gene have been associated with renal hypodysplasia/aplasia-1 (RHDA1) and with several animal models of chronic kidney disease. Alternate splicing results in multiple transcript variants encoding distinct isoforms. [provided by RefSeq, Apr 2014]

Forensic Context

A study in porcine skin demonstrated that the ITGA8 was significantly decreased in response to thermal exposure at 7 days post-injury [Price et al. DOI:10.080/15569520903097754].