Basic Information

Symbol
ITGAD
RNA class
mRNA
Alias
Integrin Subunit Alpha D ADB2 CD11d CD11 Antigen-Like Family Member D Leukointegrin Alpha D Integrin Alpha-D Beta-2 Integrin AlphaD Subunit Integrin, Alpha D CD11d Antigen
Location (GRCh38)
16:31393335-31426505
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005353.3
Sequence length
3889.0 nt
GC content
0.5636

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1520.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1588.68 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 991.39
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001318185.2 NCBI
ACUUCCCCUCAACGCGCUGCUCAGGGAUGACCUUCGGCACUGUGCUUCU… 3892 nt 0.5637
NM_005353.3 NCBI
ACUUCCCCUCAACGCGCUGCUCAGGGAUGACCUUCGGCACUGUGCUUCU… 3889 nt 0.5636
Summary

This gene belongs to the beta-2 integrin family of membrane glycoproteins, which are are composed of non-covalently linked alpha and beta subunits to form a heterodimer. It encodes the alpha subunit of the cell surface heterodimers and is involved in the activation and adhesion functions of leukocytes. The gene is located about 11kb downstream of the integrin subunit alpha X gene, another member of the integrin family. It is expressed in the tissue and circulating myeloid leukocytes. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Dec 2015]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly upregulated the ITGAD in oligodendrocytes, specifically within the regulation of actin cytoskeleton pathway, indicating a role in cytoskeletal remodeling and cellular adhesion processes in the cortical brain regions following drug exposure [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649].