Basic Information

Symbol
ITGAL
RNA class
mRNA
Alias
Integrin Subunit Alpha L LFA-1 LFA1A CD11A Integrin, Alpha L (Antigen CD11A (P180), Lymphocyte Function-Associated Antigen 1; Alpha Polypeptide) Lymphocyte Function-Associated Antigen 1, Alpha Polypeptide Leukocyte Function-Associated Molecule 1 Alpha Chain Leukocyte Adhesion Glycoprotein LFA-1 Alpha Chain CD11 Antigen-Like Family Member A Integrin Alpha-L LFA-1A Antigen CD11A (P180), Lymphocyte Function-Associated Antigen 1, Alpha Polypeptide Integrin Gene Promoter Antigen CD11A (P180) CD11a Antigen LFA-1 Alpha
Location (GRCh38)
16:30472658-30523567
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002209.3
Sequence length
5129.0 nt
GC content
0.5525

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1962.17 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2047.24 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1207.90
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001114380.2 NCBI
AUCAUUUUCCUCUUUCACCCUGUCUAGGUUGCCAGCAAAUCCCACGGGC… 4877 nt 0.5548
NM_002209.3 NCBI
AUCAUUUUCCUCUUUCACCCUGUCUAGGUUGCCAGCAAAUCCCACGGGC… 5129 nt 0.5525
Summary

ITGAL encodes the integrin alpha L chain. Integrins are heterodimeric integral membrane proteins composed of an alpha chain and a beta chain. This I-domain containing alpha integrin combines with the beta 2 chain (ITGB2) to form the integrin lymphocyte function-associated antigen-1 (LFA-1), which is expressed on all leukocytes. LFA-1 plays a central role in leukocyte intercellular adhesion through interactions with its ligands, ICAMs 1-3 (intercellular adhesion molecules 1 through 3), and also functions in lymphocyte costimulatory signaling. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the ITGAL was significantly expressed in classical monocytes from patients with acute myocardial infarction and plaque rupture, where it is involved in leucocyte-endothelial cell adhesion [Jun Qian et al. DOI:10.3389/fimmu.2022.908815]. In a separate human study on sepsis, the ITGAL was identified as one of 40 co-regulated genes differentially expressed in both the metabolome and transcriptome of sepsis patients compared to those with systemic inflammatory response syndrome [Chen et al. DOI:10.1038/s41598-024-59400-0].