Basic Information

Symbol
ITGB5
RNA class
mRNA
Alias
Integrin Subunit Beta 5 Integrin Beta-5 Testis Secretory Sperm-Binding Protein Li 217p Integrin, Beta 5
Location (GRCh38)
3:124761948-124901418
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002213.5
Sequence length
4440.0 nt
GC content
0.5462

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1710.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1790.26 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 909.17
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001354764.2 NCBI
AACUUUCAUUUUAUUAUUUCUUUUUAUCGAGACAGAGUCUCACCCUGUC… 4158 nt 0.5161
NM_001354765.1 NCBI
GUGCCCCGCCCCUUUCCCGUGGCGACGGGCGGCUAAGCAACGGGAGCGG… 4090 nt 0.5205
NM_001354766.2 NCBI
AACUUUCAUUUUAUUAUUUCUUUUUAUCGAGACAGAGUCUCACCCUGUC… 4023 nt 0.5168
NM_002213.5 NCBI
AGAGUGUGCCGGCGCGCGGGGGAGUCUCGGCGCUGGGCGCGUCUCGGAG… 4440 nt 0.5462
Summary

This gene encodes a beta subunit of integrin, which can combine with different alpha chains to form a variety of integrin heterodimers. Integrins are integral cell-surface receptors that participate in cell adhesion as well as cell-surface mediated signaling. The alphav beta5 integrin is involved in adhesion to vitronectin. [provided by RefSeq, Aug 2017]

Forensic Context

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