Basic Information

Symbol
ANKRD36B
RNA class
mRNA
Alias
Ankyrin Repeat Domain 36B CLL-Associated Antigen KW-1 KIAA1641 Ankyrin Repeat Domain-Containing Protein 36B Melanoma-Associated Antigen FLJ21281
Location (GRCh38)
2:97492663-97589877
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Forensic psychiatry evaluation Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001393939.1
Sequence length
4453.0 nt
GC content
0.4031

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1127.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1215.70 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1420.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001393939.1 NCBI
CUUCUGUUGGGCGUUUCUGCGGAGAGGCGGGAGGCGCUGAGAGUCUGCG… 4453 nt 0.4031
NM_025190.4 NCBI
CUUCUGUUGGGCGUUUCUGCGGAGAGGCGGGAGGCGCUGAGAGUCUGCG… 5898 nt 0.4040
Summary

Enables identical protein binding activity. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A single-nucleus transcriptomics study in human postmortem brain tissue identified the ANKRD36B as a protein coding gene downregulated in the MSN.3 cell type (a subpopulation of medium spiny neurons) in the nucleus accumbens of individuals with alcohol use disorder compared to controls [Van Den Oord et al. DOI:10.1111/Adb.13250].