Basic Information

Symbol
ITGB8
RNA class
mRNA
Alias
Integrin Subunit Beta 8 Integrin Beta-8 Integrin, Beta 8
Location (GRCh38)
7:20330609-20415754
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002214.3
Sequence length
8974.0 nt
GC content
0.3873

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2335.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2510.71 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2274.96
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_002214.3 NCBI
AGAGCGCGCCAGCAACUCGGGCUCUGGACUGCGGGACGCCUGAGCCGCG… 8974 nt 0.3873
Summary

This gene is a member of the integrin beta chain family and encodes a single-pass type I membrane protein with a VWFA domain and four cysteine-rich repeats. This protein noncovalently binds to an alpha subunit to form a heterodimeric integrin complex. In general, integrin complexes mediate cell-cell and cell-extracellular matrix interactions and this complex plays a role in human airway epithelial proliferation. Alternatively spliced variants which encode different protein isoforms have been described; however, not all variants have been fully characterized. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A single-cell transcriptomic analysis in a rat model of radiation-induced lung injury identified the ITGB8 as an orthologous rat gene associated with inflammatory processes [Shi et al. DOI:10.17305/bb.2024.10357].