Basic Information

Symbol
ITK
RNA class
mRNA
Alias
IL2 Inducible T Cell Kinase EMT LYK PSCTK2 Interleukin-2-Inducible T-Cell Kinase Tyrosine-Protein Kinase ITK/TSK IL-2-Inducible T-Cell Kinase T-Cell-Specific Kinase EC 2.7.10.2 Kinase EMT Homolog Of Mouse T-Cell Itk/Tsk IL2-Inducible T-Cell Kinase IL2 Inducible T-Cell Kinase Tyrosine-Protein Kinase LYK Tyrosine-Protein Kinase Lyk EC 2.7.10 LPFS1
Location (GRCh38)
5:157142933-157255185
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005546.4
Sequence length
4508.0 nt
GC content
0.4508

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1388.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1477.26 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1300.54
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_005546.4 NCBI
AACGUUGAAGGCAAGUUGCCCUUGAGCAGCUCUCUGAAGAUCAACUGCC… 4508 nt 0.4508
Summary

This gene encodes an intracellular tyrosine kinase expressed in T-cells. The protein contains both SH2 and SH3 domains which are often found in intracellular kinases. It is thought to play a role in T-cell proliferation and differentiation. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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