Basic Information

Symbol
ITM2A
RNA class
mRNA
Alias
Integral Membrane Protein 2A BRICD2A E25A BRICHOS Domain Containing 2A Protein E25
Location (GRCh38)
X:79360384-79367697
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Wound age identification Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004867.5
Sequence length
1616.0 nt
GC content
0.3985

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-425.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -459.73 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 463.38
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001171581.2 NCBI
AGUAGUGUUAGACUGAAGAUAAAGUAAGUGCUGUUUGGGCUAACAGGAU… 1484 nt 0.3902
NM_004867.5 NCBI
AGUAGUGUUAGACUGAAGAUAAAGUAAGUGCUGUUUGGGCUAACAGGAU… 1616 nt 0.3985
Summary

This gene encodes a type II membrane protein that belongs to the ITM2 family. Studies in mouse suggest that it may be involved in osteo- and chondrogenic differentiation. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2010]

Forensic Context

A study in human skin wound healing identified the ITM2A as a marker for an ITM2A+ pro-inflammatory fibroblast subcluster (FB-II) [Liu et al. DOI:10.1016/j.stem.2024.11.013].