Basic Information

Symbol
ITPKB
RNA class
mRNA
Alias
Inositol-Trisphosphate 3-Kinase B Inositol 1,4,5-Trisphosphate 3-Kinase B IP3-3KB IP3KB InsP 3-Kinase B IP3 3-Kinase B EC 2.7.1.127 IP3K B Proliferation-Inducing Protein 37 IP3K-B PIG37 IP3K
Location (GRCh38)
1:226631688-226739323
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002221.4
Sequence length
6269.0 nt
GC content
0.5814

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2648.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2754.28 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1476.91
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001388404.1 NCBI
GGGCAGUAUCUCCACGGUCGAAAAGGGCGUGCAGGGCCGGCUUGGCGUC… 3125 nt 0.5971
NM_002221.4 NCBI
GGGCAGUAUCUCCACGGUCGAAAAGGGCGUGCAGGGCCGGCUUGGCGUC… 6269 nt 0.5814
Summary

The protein encoded by this protein regulates inositol phosphate metabolism by phosphorylation of second messenger inositol 1,4,5-trisphosphate to Ins(1,3,4,5)P4. The activity of this encoded protein is responsible for regulating the levels of a large number of inositol polyphosphates that are important in cellular signaling. Both calcium/calmodulin and protein phosphorylation mechanisms control its activity. [provided by RefSeq, Jul 2008] CIViC Summary for ITPKB Gene

Forensic Context

A multi-omics study in human postmortem prefrontal cortex (Brodmann Area 9) from individuals with cocaine use disorder (CUD) identified the ITPKB as both differentially expressed and differentially spliced, with these molecular changes converging in synaptic signaling and neuron morphogenesis pathways [Zillich et al. DOI:10.1038/S41398-024-03139-9].