Basic Information

Symbol
ANKRD9
RNA class
mRNA
Alias
Ankyrin Repeat Domain 9 Ankyrin Repeat Domain-Containing Protein 9
Location (GRCh38)
14:102501767-102509824
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_152326.4
Sequence length
6705.0 nt
GC content
0.5870

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3230.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3332.27 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1591.67
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001348651.2 NCBI
CUGCCUGGCCGGGGCCGCACUGCGCCGCCCGCCGCCCGCCGCCCGCCGC… 6711 nt 0.5868
NM_001348652.2 NCBI
CUGCCUGGCCGGGGCCGCACUGCGCCGCCCGCCGCCCGCCGCCCGCCGC… 6499 nt 0.5876
NM_152326.4 NCBI
CUGCCUGGCCGGGGCCGCACUGCGCCGCCCGCCGCCCGCCGCCCGCCGC… 6705 nt 0.5870
Summary

Enables ubiquitin-like ligase-substrate adaptor activity. Involved in intracellular copper ion homeostasis; proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; and protein ubiquitination. Located in cytoplasmic vesicle and cytosol. Part of Cul5-RING ubiquitin ligase complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans identified ANKRD9 as one of six key cuproptosis-related diagnostic biomarkers for sepsis, showing it was highly expressed in platelet cells from septic patients in single-cell RNA sequencing analysis and its dysregulated expression was validated in an independent cohort [Wang et al. DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27379].