Basic Information

Symbol
IVD
RNA class
mRNA
Alias
Isovaleryl-CoA Dehydrogenase ACAD2 IVDH Isovaleryl-CoA Dehydrogenase, Mitochondrial Isovaleryl Coenzyme A Dehydrogenase Butyryl-CoA Dehydrogenase Epididymis Secretory Sperm Binding Protein Isovaleryl CoA Dehydrogenase EC 1.3.99.10 EC 1.3.8.4 EC 1.3.8.1 EC 1.3.99
Location (GRCh38)
15:40405485-40435947
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Time since deposition estimation Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002225.5
Sequence length
4350.0 nt
GC content
0.5324

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1649.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1726.48 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1345.09
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001159508.3 NCBI
AGUUUCAGCGCUGGCUCUUCGUGCAUGGCAGAGAUGGCGACUGCGACUC… 4260 nt 0.5317
NM_001354597.3 NCBI
AGUUUCAGCGCUGGCUCUUCGUGCAUGGCAGAGAUGGCGACUGCGACUC… 4729 nt 0.5405
NM_001354598.3 NCBI
AGUUUCAGCGCUGGCUCUUCGUGCAUGGCAGAGAUGGCGACUGCGACUC… 1784 nt 0.5740
NM_001354599.3 NCBI
AGUUUCAGCGCUGGCUCUUCGUGCAUGGCAGAGAUGGCGACUGCGACUC… 4437 nt 0.5344
NM_001354600.3 NCBI
AGUUUCAGCGCUGGCUCUUCGUGCAUGGCAGAGAUGGCGACUGCGACUC… 1871 nt 0.5767
NM_001354601.3 NCBI
AGUUUCAGCGCUGGCUCUUCGUGCAUGGCAGAGAUGGCGACUGCGACUC… 1702 nt 0.5752
NM_002225.5 NCBI
AGUUUCAGCGCUGGCUCUUCGUGCAUGGCAGAGAUGGCGACUGCGACUC… 4350 nt 0.5324
Summary

Isovaleryl-CoA dehydrogenase (IVD) is a mitochondrial matrix enzyme that catalyzes the third step in leucine catabolism. The genetic deficiency of IVD results in an accumulation of isovaleric acid, which is toxic to the central nervous system and leads to isovaleric acidemia. Alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2017]

Forensic Context

A study in *Phormia regina* maggots demonstrated that the IVD (ivd) is an RNA marker for maggot age estimation, showing downregulated expression as maggots age from 80 to 130 hours, which was consistently identified by differential expression, weighted gene co-expression network, and generalized linear model analyses [Lin et al. DOI:10.1371/journal.pgen.1011948]. This downregulation suggests a metabolic shift away from amino acid oxidation during late larval development, and its expression pattern provides a molecular basis for distinguishing maggot age when physical traits are unreliable.