Basic Information

Symbol
IVNS1ABP
RNA class
mRNA
Alias
Influenza Virus NS1A Binding Protein NS1-BP KLHL39 ARA3 Aryl Hydrocarbon Receptor-Associated Protein 3 KIAA0850 HSPC068 NS-1 ND1 Influenza Virus NS1A-Binding Protein Kelch-Like Family Member 39 Kelch-Like Protein 39 NS1-Binding Protein FLARA3 NS1BP Aryl Hydrocarbon Receptor-Associated 3 NCX Downstream Gene 1 IMD70 NS1
Location (GRCh38)
1:185292931-185317780
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Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006469.5
Sequence length
4113.0 nt
GC content
0.4024

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1138.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1219.42 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1049.54
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_006469.5 NCBI
AGUGUCUCCCGGUCGCGCGUGGAGGUCGGUCGCUCAGAGCUGCUGGGCG… 4113 nt 0.4024
Summary

Predicted to enable ubiquitin-like ligase-substrate adaptor activity. Involved in RNA splicing; negative regulation of protein ubiquitination; and response to virus. Located in cytosol. Implicated in immunodeficiency 70. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in pigs (Sus scrofa domesticus) demonstrated that the IVNS1ABP was uniquely upregulated in the biceps femoris and longissimus dorsi muscle of cold-exposed Bama pigs, a cold-sensitive breed, as part of a distinct transcriptional immune/inflammatory response to short-term cold exposure [Yang et al. DOI:10.3390/ijms24087431].