Basic Information

Symbol
IYD
RNA class
mRNA
Alias
Iodotyrosine Deiodinase DEHAL1 C6orf71 Iodotyrosine Dehalogenase 1 Iodotyrosine Deiodinase 1 DJ422F24.1 IYD-1 Chromosome 6 Open Reading Frame 71 EC 1.21.1.1 TDH4
Location (GRCh38)
6:150368892-150405969
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_203395.3
Sequence length
8622.0 nt
GC content
0.4317

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2635.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2796.15 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2016.84
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001164694.2 NCBI
GUGACGUCAGACUCCAGACCAUGUAUUUCCUGACUCCCAUCUUGGUAGC… 8734 nt 0.4335
NM_001164695.2 NCBI
GUGACGUCAGACUCCAGACCAUGUAUUUCCUGACUCCCAUCUUGGUAGC… 8683 nt 0.4314
NM_001318495.2 NCBI
GUGACGUCAGACUCCAGACCAUGUAUUUCCUGACUCCCAUCUUGGUAGC… 8554 nt 0.4317
NM_203395.3 NCBI
GUGACGUCAGACUCCAGACCAUGUAUUUCCUGACUCCCAUCUUGGUAGC… 8622 nt 0.4317
Summary

This gene encodes an enzyme that catalyzes the oxidative NADPH-dependent deiodination of mono- and diiodotyrosine, which are the halogenated byproducts of thyroid hormone production. The N-terminus of the protein functions as a membrane anchor. Mutations in this gene cause congenital hypothyroidism due to dyshormonogenesis type 4, which is also referred to as deiodinase deficiency, or iodotyrosine dehalogenase deficiency, or thyroid hormonogenesis type 4. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Sep 2009]

Forensic Context

A study in humans using post-mortem tissue RNA sequencing demonstrated that the IYD gene was downregulated as part of the inhibited metabolism of amino acids and derivatives pathway in the hippocampus and kidney during septic shock [Pinheiro da Silva et al. DOI:10.1111/jcmm.17938].