Basic Information

Symbol
JAK3
RNA class
mRNA
Alias
Janus Kinase 3 L-JAK JAK-3 Tyrosine-Protein Kinase JAK3 Leukocyte Janus Kinase JAK3_HUMAN JAKL LJAK EC 2.7.10.2 Janus Kinase 3 (A Protein Tyrosine Kinase, Leukocyte) EC 2.7.10
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Other applications

MANE select

Transcript ID
NM_000215.4
Sequence length
5386.0 nt
GC content
0.5837

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2191.91 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2281.91 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1098.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..........((((..(((((((((((((((.....))).(((.((((.((.((((((((........)))((((...(((....))))))).....((((((((.......))))))))))))).))...)))).)))(((.((((.(.((((((((((...(((((((........((((((((((((......(((.(((..((((((((.(((((((.....((...((((((((((.((.(.(((............))).).))((((((((((..(((...(((((......)).))).)))..)))))))))))))))))).)).))..)).))))))))))))).))))))......))))))..((((((((((.(((((.((((..(((.....(((....(((((((..(((....))))))))))....))).....))).)))).))))))))))).))))(((....)))(.((.((((.((((......)))))))).)).)))))))((((.((((...)))).))))...)))))))....)))))))..))).)..)))).))).((((((((....).)))))))....((((..(((...(((((((((((((((((((...((....(((((..(((((....((((..(.((((((((.((......(((((((((.((((((....)))))).((((((...(((((((((....(((((...(((((..(((((.(.....).))).))..)))))))))).(((((.(((.(((((((..(((..((((((((((..((((..((((((((.......))).)))))))))..)).))))))))..)))..))))))).))).))))).(((((((((.(((.(((((.........(((((.((...)))))))...(((((..((((.((((.(((((((..(((((.((((.(((((((((.((.....(((((..(((((.....)))))...)))))......(((((.(((....((((((.....(((((((((((..(((((((((((.(((.(.(((.((((((((.(.((.(((........((((((((.....))))))))......))).))).)))))))).))).)))).).))))))))))((((((.....((((.........((..(((((((((((((((.(((...(((((((((...............(((((((((.((((...(((((...........)))))...))))...........(((((((.......(((((((.((....)).)))))))..)))).)))........(((((((....)))))))((.((((((....(.((.....)).)....))))))))...)))))))))((((((((((((((((.(((((((((((........)).......((((....((..((......))..))..))))..))).)))))).).)))))).)))((((..(((((((((................)))))))))))))........((((((((.((.....(((((((((((((....(((((((((....(((.(((((.(((....(((((..(((....)))....)))))....)))))))))))..(((.(((((((((((((..(((.....(((.(((.(((.......))).))).)))...)))...))))))..((....((((((.((.(((((((((((((...)))))((((((((((((((.((..((((((((((...((((((.(((((..(((((.((((.(((((((((.....(((....))).....)))))).)))))))...((((((((...(((......)))....))))))))......((((.........)))))))))..))))).))))))...)))))..((((((..((((((...(((((((((((((((((((((((((((((...(((((((((((((((....(((((....)))))(((((((...(((((((((((((.(((.((((....))))..))).....))))))))))))).))))))).))))))))))))....)))...)).)))))..((((((((...(........)....))))))))......)))))))).((((((((.((.(((.......((((......((.((.(((((((...))))))).)).))..)))).......((((.(((............))).))))....))).))))))).)))))))))))))))))((((....)))).....((((..((...(((((.....(((((((.((((((.(((..(((..(((((....)))))..)))..)))))).)))(((((((.(((((((((((.(((((((..(((....((..(...((((...((.....))...))))...)..))....)))....)))))))))))))))))).).))))))...((((((((..((.......))..))))))))..((((....(((.(((((..((((((....(((((((......(((((((((.(((.(((.(((((......(((..((((((....))))))..))).(((((((((((((...((((((((......(((...((((((((.(((.(((....(((...((((.((((.(((((......))).))))))))))..))).))).))))))))))))))...((((((((((.(((....))).)))).))))))..))))))))......))))...)))))))))(((((((((.........((((((.....)))))).....((((((...........((((..(((......)))))))))))))...((((((...)))))).))).))))))((((((.......)))))).....(((((((...(((.(((((....(((.((......))..))).)))))))).)))))))((((((.(((.((((((.........((((........))))(((....))).)))))).))))))))).))))).)))(((((.....)))))..))).))))....))))))))))))(((((((((.(......).))).))))))))))))..))))).))))))))))))))))))).)).))))(((((((.......)))...)))).......))))))))))))..))))))).))))))))))))))(((((((((((((((((((.((..((((.(((((..(((..((((((((............))))))))..........((((((..(((((.......)))))((((((.((.((((((...((...((((((((((((..(((((...((((((...))))))...)))))((((.......))))...((((((............)))))))))).))).)))))))...)))))).))((((((.(((...))).))))))...))))))))))))...))).)))))))))....((..((((.((........)).))))..)).......)).))))))).....(((.............))).)))))).))))))...((((((((....................................))))))))(((((((((((.....)))))).))).))...)))))))))).))))))..)).))))))))))))))))))).........((.(((((.(((((((((......))))).....((((((......)))))).)))).......(((((((((...)))))))))((((((.(((..(((..(((((((....((..((((.......)).))...)).....))))))).)))..))).))))))...))))).))))))))....))))))).....(((((((((..((.......))..))))))))))))))))))))))))).(((((((..(((.....))))))))))..(((.((...)))))................)))))))))...))).)))))))))))))))..)).......))))))))))(((....)))..........................)))))))))))))))))..(((((((.((((((.(((((((.........)).)))))...))))))...)))))))............)))))))).))))))....((((((((......(((....)))......))))))))................((.((((((((...((((...(((((...((((((...)))))).)))))...))))....)))))))).)).(((((......))))).....))).)).)))).)))))..))))................))).))))))))..))))).....)))))))))))))))))..((((((.((((((....(((.(((((((((((((((((((((((((.(((...))).(((.(((((((.((...)).)))))))))).))))))).)))))))))).))))......)))).)))..))))))..)))))).....(((((.........)))))((((((.((((((..........)))))).))))))...........)))))))))......)))))).....((((((((..(((((....(((((((((((((..(((((...)))))...((((((..((((....((((...))))....)))).))))))......(((((((((((((...))).)).)).)))))))))))).(((((((((.((((..(((..((..(((((((...(((((((.(......).)))))))))))))).)))))....)))).).))))))))......(((((((..(((....)))..........))))))).......)))))))....)))))...((((.........))))...............((............))..))))))))............((((....))))..))))))))).(((((((((((.........)))))))))))..)).))))))))))))).....)))))...)))))))..)))))))).)))))..)))))).))))))).))))))))))))....))))((.(((((((......))))))).))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
..{{........((((((((((((.,,.(((.((..((({{((.((((.((.((((((,,.....,..|,|((((...(((....)))))))},...{(((((((.......))))))))))))).))...)))).)))))).)}..((((((...)))))).(((((.({.........{,.(((((((......(((.(((..((((((((.(((((((,,...((...((((((((((,({.(.({{............})).}.))|(((((((((..(((...({(((,,,...,}}))),)))..)))))))))))))))))).)).))..)).))))))))))))).))))))......)))))))..))...))))))).,.{(((((((.(((((((((..(.(..((((((((((.(((((.(((..({{..,...}}}((((((.(((((({{(((((.(((((........)))))..)))))}(((((..(((.(((((.((.(((.((((((((.((((...)))).)))((((,...,)).)).((((((((((((((,...((((((...(,((,,{{.{{.((((({{{......})))).....))))),))..}}.,...))))))))).))..)))).)))))...))))).))).)).))))).)))..)))))(((,.((((((....))))))..))),((((.((((...))))..))))..,(((((..(((((.(.....).))).))..)))))}((((.(((((.(({.(((((((..(((..((((((((((..((((..((((({({,,....,)}).)))))))))..)).))))))))..)))..))))))).})).))))).)))).......})))))).))))))....(((((((.(({...})).))))))).....({.....)).((((..({,,....))..))))))).)))))...(((((..(((((.....)))))...)))))........)))))))}}))..).)..)))))))))..........)))))))}(((((.(((((......))))).)))))..((((..(((.......)))..))))(((((((.((...(((((((......)))))))..)).)))))))))),,....))))))))))))....,((((((((..{{{.(((((((((...(,...(((......,......)}}),)))))))))..|},.(((((...........))))).,,.((((((.(((((((.((.((((......(((((((,({....)).)))))))...{{{(,,,..,,,...)}}}((((((((({{{{.,,,,{{{,|||,..{{{{{.((((({(,..,|||((((((..(((((((.((...(((((((((((.(((((((((.,......,,{......,,|{{{....{{..{(......}}..)}.,))},..))).)))))).)})))))).)))).......)).))))))).))))))....,(({.(((((((((.((((({,..,,{...,{|({{,,.}||.,||(((,(((((((..{({((((({{((.{{..,..,,,.}.......(((((((..((...(((((((((({,{(((((((.|{,{({{(..(((((((((((,{(((...(((,{(,..(((..((((.(((.((((......(((((((((((.(.({,,,.((((((.((.(((((((((((({...})))}((((((((((((((.(,.{((((((((((...((((((.(((((..(((((.((((.(({((((((.....{((....))}.....)))))).))}))))...((((((((...(((......)))....))))))))......((((.........)))))))))..))))).))))))...))))),.((((((..((((((...((((((((((((((((((((((((((({(...(((((((((((((((....{((((....))))}(((((((...(((((((((((((.((,.((((....)))),,)}}.....))))))))))))).))))))).))))))))))))....)))...)}})))))..((((((((...(,.....,.,....))))))))......)))))))).((((((((,((.(((.......((({.,{,..,(.((.(((((((...))))))),)).,)}})))).....,.((((.(((,,......,,,.))).))))....))).))))))).))))))))))))))))){{{,.,,,|||},,,..,{(,{,{{{,{,.,,|}.,{||((((((.{{,(((.{((,,(((..(((((....)))))..))).,)))))).))}(((((({,(((((((((({,(((((((..(((..,.{(,.,,.,({({....|,,,..)}...))}}...,..))}...)))...,)))))))))))))))))).),})))))...((((((((,.{(......,})},)))))))).{((({....(((.(((((..((((((....(((((((,{{{..{{{,,((((.(({.(((.((((|,.....(((,.((((((....)))))),.})).(((((((((,,((..{(((..(((,,.{{,({{...((((((((.(((.(((....{((...((((.((({{(((({......))).)))))))))),.)}).))).)))))))))))......((((((((((.(((....))).)))).))))))...})))))}),,)))),,)}..)))))))))(((((((((.........((((((.....)))))).....((((((...........((((..(((......)))))))))))))...((((((...)))))).))).))))))((((({.......)))))),..,,(((((((...(((.(((((....,,,.,,..,...|}..}},.)))))))).))))))){(((((.(((.((((((........|((((......}.)))))|,....))}.)))))).))))))))),))))).)))(((((.....)))))..})).))))|||,,|,..)))))))(((((((((.|.|,...}.))).))))))))))))..))))),))))))))))}}}||||.{((({,{(((((.....))))}.}).},,)))..,,,,..))))))))))))..})))))).))))))))))))))(((((((((((({((((((,((..((({{(((((..(((..{(((((((............)))))))}..........((((({.{(((((.......)))))|(((({.{(.((((((...,,..{((((((((((((..(((((...((((((...))))))...)))))((((.......))))...((((((,{......,,..))))))))))))}).)))))),...)))))).)}{(((((.(({...})).)))))},..))))),,)))))...))).)))))))))....||,|((((.((........)).)))}..},.......}}.))))))},,...,,..........,,.,}}),)))))).))))))...((((((((....................................))))))))(((((((((((.....))))))}))).))...)))))))))).))))))..}),,.),)))))))}}))))))).))).))))..))),|{{||,|||.,.,{{{{{|||......((((,....}}}),.,))}))))},{{,(({((({,..,}),)))))}{{((,.((({,.({{.((..(((,|{,.........}}}..}}}}}.)))).))}}..)))))))),{((({..,{,,|(((.....(((((.(((,({{{{..{{{{||,,,....(((((((((..((.......))..))))))))){((((((..(((..{,.,,{,,||}.|}}}}}}.,,.)))))),..))))),,,))}.))))).....)))..,,,,,,)))))...,))))))).}))))},})))}}||||,,...,,,.,,})))}},.,,,...........................,,((((((((...))))))))(((((((.((((((.(((((((.{.......)).)))))...))))))...))))))),,.))))),,))),.))..))))))),.,,,((((((((......(((....)))......))))))))......,,........,,.((((((((...((((...(((((...((((((...)))))).)))))...))))....)))))))).|||(((((......)))))....,))}..}}}))).)).))))))..))))))).)))},))))))...))))))))),.))|,,..{{.,,,,...,,...)))){{{{{{.{{{{{{....{{{.||||||||{{((({(((({((({{{.|{|,,,))),(((,((((((({{{.,,||.}}}||||}}|,||}}|}}.|||||||||}.}}}}......|}}}.|||,.}}}}}}..)))))),,...{{{{{.........)))))||||{{.{{||||..,,,,....)))))},)))))),,..,,|,,....})|})))|.,,,})}..,,.....(((((((((.(((,......,...(((((((..((.(({,(((.(((.(..((((..((((,(((((({,(((((,(((,...,}}),||.......,(((((((({{(((...}}),)}.)).))))))}...,..(((((((((.((((..(({..{(..(((((({...(((((((.{......,,)))))))))))))).))}},....)))).).)))))))).......(((((..{((({{.{{{.............,.)))}))))}.}))))..}))}})))))))|(((......,,.))),.........)))).))))..}.))).)))))))).)))))))...........((((....)))).))).))))))))),(((((((.....(((((((((((.(((((.,.{.(((....))),....))))).).)))))))))}.....))))))))))))))))))))).)).))))))).))))))...))))))))|((((((......)))))))))....

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GCCCGCCCUUCGAAAGUCCAGGGUCCCUGCCCGCUAGGCAAGUUGCACU… 5386 nt 0.5837
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the Janus kinase (JAK) family of tyrosine kinases involved in cytokine receptor-mediated intracellular signal transduction. It is predominantly expressed in immune cells and transduces a signal in response to its activation via tyrosine phosphorylation by interleukin receptors. Mutations in this gene are associated with autosomal SCID (severe combined immunodeficiency disease). [provided by RefSeq, Jul 2008] CIViC Summary for JAK3 Gene

Forensic Context

A study in human postmortem brain tissue identified the JAK3 as an OUD-specific hub gene within a dorsolateral prefrontal cortex co-expression network, implicating it in inflammatory regulatory processes associated with opioid use disorder [Seney et al. DOI:10.1016/j.biopsych.2021.06.007].