Basic Information

Symbol
JAML
RNA class
mRNA
Alias
Junction Adhesion Molecule Like AMICA1 Gm638 AMICA Adhesion Molecule Interacting With CXADR Antigen 1 Adhesion Molecule, Interacts With CXADR Antigen 1 Junctional Adhesion Molecule-Like Dendritic-Cell Specific Protein CREA7-1 Dendritic-Cell Specific Protein CREA7-4 Dendritic Cell-Specific Protein CREA7-1 Adhesion Molecule AMICA CREA7-1 CREA7-4
Location (GRCh38)
11:118193725-118226323
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification Individual identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001098526.2
Sequence length
1876.0 nt
GC content
0.4925

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-631.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -668.19 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 505.41
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001098526.2 NCBI
AGUUGAGCUUGGGGACUGCAGCUGUGGGGAGAUUUCAGUGCAUUGCCUC… 1876 nt 0.4925
NM_001286570.2 NCBI
AGUUGAGCUUGGGGACUGCAGCUGUGGGGAGAUUUCAGUGCAUUGCCUC… 1813 nt 0.4937
NM_001286571.2 NCBI
AAGAGCAAGGAACAACCCAUUUCGUCGUUAUGAUUAUUCCUUGGGCCUG… 1774 nt 0.4899
NM_153206.3 NCBI
AAGAGCAAGGAACAACCCAUUUCGUCGUUAUGGUAAGUGGAGAUUAUUC… 1784 nt 0.4899
Summary

Enables integrin binding activity and protein homodimerization activity. Involved in heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules and myeloid leukocyte migration. Located in bicellular tight junction; nucleoplasm; and plasma membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans developed and validated an mRNA-cSNP panel for simultaneous body fluid identification and individualization, where the JAML was included as a venous blood-specific mRNA gene and cSNP marker (rs1793174, rs2298831) for both identification and donor individualization [Zhiyong Liu et al. DOI:10.1007/s00414-025-03434-0]. Another human study using whole transcriptome shotgun sequencing on low-template blood samples identified the JAML gene as a candidate blood-specific mRNA biomarker and identified several SNPs within it as candidate body fluid identification markers [Jepsen et al. DOI:10.1016/j.fsigen.2024.103089]. A study in humans demonstrated that the JAML functions as an mRNA marker for blood identification and was used as a leukocyte marker in a forensic multiplex PCR system [van den Berge et al. DOI:10.1016/j.fsigen.2015.10.011]. A subsequent human study targeting coding region single nucleotide polymorphisms (cSNPs) for donor association included two cSNPs in the JAML gene, with RNA samples from blood aligning mainly with the JAML and ANK1, and these markers contributed to a high power of discrimination for blood [Trnka et al. DOI:10.1016/J.Fsigen.2026.103455].