Basic Information

Symbol
JDP2
RNA class
mRNA
Alias
Jun Dimerization Protein 2 Progesterone Receptor Co-Activator JUNDM2
Location (GRCh38)
14:75427716-75474111
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001135048.2
Sequence length
5378.0 nt
GC content
0.5182

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2047.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2143.21 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1165.57
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001135047.2 NCBI
CUCGAGCGCUCCUGCACCGUGGGGUGGCGGAGCCGGGGGACUGCAUGGA… 5273 nt 0.5090
NM_001135048.2 NCBI
GCCGCCCGCCACAGCCUGCGGGAGGGACGCUCGGCGGCCGCGACGGGGG… 5378 nt 0.5182
NM_001135049.1 NCBI
CUGAAGAGGGCCUUUUGCUGCUCGCCUUCACUCUCAGUCUUGGGGCCUU… 3960 nt 0.5273
NM_130469.3 NCBI
GCCCCAGCCCAGCCCCGCGGGGAGGCUCCCGCAGCCCAGGGACCUCGAG… 4007 nt 0.5428
Summary

Enables DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific and sequence-specific double-stranded DNA binding activity. Involved in negative regulation of transcription by RNA polymerase II. Located in nucleus. Part of RNA polymerase II transcription regulator complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the JDP2 transcript was upregulated in spleen leukocytes at 2 hours post-injury across three distinct models of systemic inflammation (trauma/hemorrhage, burn injury, and LPS infusion), identifying it as part of a common early transcriptional response to injury [Brownstein et al. DOI:10.1152/physiolgenomics.00213.2005]. Separate research in zebrafish and mice found that the JDP2 transcript abundance increased within 0.1 hours postmortem, categorizing it within apoptosis, epigenetic regulation, and cancer-related functional groups of genes that become more abundant after organismal death [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267].