Basic Information

Symbol
JPT1
RNA class
mRNA
Alias
Jupiter Microtubule Associated Homolog 1 ARM2 Androgen-Regulated Protein 2 HN1A HN1 Hematological And Neurological Expressed 1 Protein Hematological And Neurological Expressed 1
Location (GRCh38)
17:75135248-75168281
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_016185.4
Sequence length
1434.0 nt
GC content
0.5014

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-476.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -500.40 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 273.86
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001002032.3 NCBI
AGCGGCGGCUCCUGCAGCGGUGGUCGGCUGUUGGGUGUGGAGUUUCCCA… 1415 nt 0.5025
NM_001002033.3 NCBI
AGCGGCGGCUCCUGCAGCGGUGGUCGGCUGUUGGGUGUGGAGUUUCCCA… 1529 nt 0.5056
NM_001288609.1 NCBI
CGUGCGCUGUGCUCGCGCCGGGGCGGGUGGCGGGGUUCUGCCGUCGGCG… 2294 nt 0.5418
NM_001288610.1 NCBI
ACUUACUUGGUGGAAGGGUUUGGAUUCUGUGGAAGGUGUCCACAUUGUC… 1657 nt 0.4707
NM_001288611.2 NCBI
AGCGGCGGCUCCUGCAGCGGUGGUCGGCUGUUGGGUGUGGAGUUUCCCA… 1438 nt 0.5007
NM_016185.4 NCBI
AGCGGCGGCUCCUGCAGCGGUGGUCGGCUGUUGGGUGUGGAGUUUCCCA… 1434 nt 0.5014
Summary

Located in several cellular components, including intercellular bridge; microtubule cytoskeleton; and nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in human cardiac tissue from forensic autopsies demonstrated that the mRNA for the JPT1 was downregulated in cases of mechanical asphyxia compared to those of craniocerebral injury, identifying it as a potential biomarker for distinguishing this cause of death [Zeng et al. DOI:10.1007/S00414-017-1616-4].