Basic Information

Symbol
JPT2
RNA class
mRNA
Alias
Jupiter Microtubule Associated Homolog 2 C16orf34 HN1L L11 Hematological And Neurological Expressed 1-Like Protein Hematological And Neurological Expressed 1 Like HN1-Like Protein FLJ13092 KIAA1426 Hematological And Neurological Expressed 1-Like Chromosome 16 Open Reading Frame 34 CRAMP_1 Like HN1 Like
Location (GRCh38)
16:1678256-1702859
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_144570.3
Sequence length
3695.0 nt
GC content
0.4853

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1230.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1294.69 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1048.16
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((.((...((((.(((((((((((((.((((.(((....((((((.....)).))))(((((...)))))...((((......))))...(((((((.....(((..((((((.((....)))))))).))).)))))))(((((..((((.......((((((((((..(((((......)))))...((((.............)))).....(((((((((((((..(((...((.....(((((((..........))).)))).....))...)))..)))).))))).)))).((((.(.(((........))).).))))..(((((.........))))).............(((((((((((.((((((((.(((((((((((((.((......)).))))...((((......((.((((((..((..(((.(((..((((((.((((.(((...........(((((.((......)).)).)))...((((.((((((...((.....))..))))))))))))).))))...)))))).....))).)))..))..)))))).)).....))))..))))))).))))))))))(((.(((((((((((.((((.((.((((...((((......(((.(((((.(.(((((((((((((.(......).))).)))))))))).).))))).)))....)))).)))))))))).((((((((((((((((.((..((..((.(((....))).))))..))))))))))))))))))......((((.((........))))))...(((((.(((((.(.(..(((((.(((.....))))))))..).).)))))))))).).)))))))))))))))))))))))).....((((......))))))))))))))))))..)).)))..............))).)))).)))))))))((((((((..(((.((....))..........................(((((((..(((.(((((...)))))....)))))))))).)))..))).)))))........)))).))))...(((((((((.((((..............((((..(((...(....).)))..))))...((((((.....((((((.(((((..........))))).))))))))))))..((((....(((.(((((.....((((((((.((......((((((((..(((((......(((((...((((.(((((........((((((((((((.(((((((((.((.......)).)))))......((((...((((((((((.((((.......))))((((((.(((.......(((.((((.(((((.....(((((((((...............((((((((((........))))).)))))......(((((.((....)).))))).)))))))))......(((((((.(.(((((((.....((......)).....)))))))......(((((((((((...)))))))))))((((((...........))))))((((((..............)))))).......(((..(((((((((((..((((...)))).....))))).....))))))...)))((....))..).)))))))(((((((((((((....)))))))..))))))...))))))))).))).)))..))))))..((((((.(((((..((((((((..((((((.(((((((((..........((((...((((((((..(((..((((..((((..(....)..))))...)))))))...)))).))))))))))))))))).((((((....)))))).....(((....)))(((((((((((((((((....(((((......)))))((((....)))).))))))...)))((((.(((((((.....((.((((.((...(((..(((..(((((....((.(((..................)))))..)))))..)))..))).)).))))))...))))))))))).........))))))))((((((((((((..(((....(((((((((.(((((..((..((.(((.(((((((.(((((.......)))))......((((((((((((.....(((((((((((((((...((((..(((((........)))))....)))).)))).)))))))))))......)))).))))))))....((((.((((((((.......))))))))...)))).((((((((((..((..((..(((((...........)))))..))..)).))))))))))((((.(((((.((.((((.(((.(.((((((((((((..(.(((((((((((.(.(.((((...........)))).))))))))..))))).).))))..)))))))).)))).((.((((((((((...((((.(((((((((((((((..(((((((..(((((((((((((((((((..(((((((((((((((((((((((((((...((((...)))).)).)))))))))..)))).)))........(((.....))))))))))))..(((((((.(((.....)))))))))).))))).........)))(((((((((..((((....))))..))))).))))((.((((((...)))))).))...)).)))((((..((((((.....((((.((((((((((((..(.(((((....(((.....(((....(((((.....))))).....)))....))).....))))))(((......)))...........(((..((((.(((...))).))))..)))......))))))))).))).))))...)))))).))))(((((.......))))).))))))))))))).))))))).)))).))))..))))...))))))..)))).))......(((((((.....))))))).)))).)).))))).)))))))))))...)))))..))..)))))...(((.(((.(((((....))))).))).))))))))))))..)))...........(((((((((((..............((((((......(((((......((.(((....))).))...))))).....))))))((((..(((((((.......)).))))))))))))))))))))((((((.....))))))(((((.......)))))..)))).)))))))).))))))..)))))))).))))).))))))...))))))))))......))))..)))).)..))))))))))))))))...((((((.((.(((.(((.......................))).)))..)).)))))).......))))..)))))...))))))))))))).))))))))))...))))).))).))))((((((.((.(((((((.((((...))))..))))))))).)))))))))).)))))))))..)).)))))...................((((..(((......))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(({,(,((,({((((.(,(((((.((,,(((.(.((((({.......))),,}))}..)),))))),))))))),.((((......)))}.,.(((((((.....(((..(((((((((....)))))))}.))).}))))))|,|(({{((.....((({((({{{{,,...{((((......))))},..((((,...,,..,,{,,|||}.....(((((((((((((..(((..{(,{..,,({{{(((..........))).})))..,.}),...)))..)))).))))).)))).{{{{.{.{{{..,,,,,,||}.}.|||}.,(({((,,,,,....}||}}.,||.,,,,,..,{{{{||{{{{{,((((((((.(((((((((((((.((......)).))),...((((...,,,((.((((((..((..(((.(((..((((((.{(((.({({,.......,.((({(.({,...,.||.}|.}})...((((.((((((...((.....))..))))))))))})),)))).,.)))))).....))).)))..))..)))))).))...},)))).,))))))).)))))))))}{{{.{{((((({{{.}||||{{{.((({...((({..,...{((,(((((,,,((({((({(((((,{.,,,....}}}.)))})))))),),))}}}.})}.,},}))),}))))))))).((((((((((((((((.{(,.((..((.(((....))).)))),,}}))))))))))))))))}}}}.}|||,.||...}}}}}||}}||{{{{{,{({({{,,,|,...{||||},{|,..,||||||||}..{{|{||||||||||{|,|}||||||}||||,|||||}}}}),}||.{{||,,,,,.||||.|||(,{{({{(({,..|,|||..|||..}}},..|}}},{{{{,{|,},,|,,|}|||||||,((((((({,.{{.............}}.,,,,}.)}}}|((((((..(((.(((({...}))))....))))))))),..))}.).)))))))),....}}})))})}||,...|||||}{|||||,,},,,.}..,,,,,{{((.,(((...{...,).)))..)))}...{{{{{{,,,,.,,.|||,|,,((((((({.....)))))))))))))})))},|||},.,.,||}||}|}.,}})}|||}}}|}}}}......,,|||}}}.{(((,{{{,,.|||||,.{||}|{{|||{,,,((,(((((((({((((({(((((((((.((.......)).)))))}.,,,.((((...((((((((((.((((.....,,||||{{((((,({,.,,,,{,(((.((((.(((((.....(((((((((...............((((((((((........))))).)))))......(((((.((....)).))))).))))))))).....,(((((((.(,{{(((((((.{(((.,,......,}}.)))),))))))}.(((((((((((...)))))))))))((((((...........))))))((((((..............)))))).......{((,.(((((((((((..((({...}}}}.....)))))....,)))))).,,))}{{....)}..,.)))))))|((((((((((((....))))))),.,))))}...))))))))).)))..}}..}}}}))..((((((.{{(((..((((((((..((((((.((((((((({,........{{((...{(,(((((..(((..((((,.((((..{....}..)))}...)))))))...))))),}},}}))))))))))).((((({....))))))...,(({{.,,,|||({((((({,,.{{{{{{.,,,,||||,,,,,.))))}{(((....)))).)}}}}}.,}))|||{{.(((((((,,,,,{{,((((,((,..{{{.,(({..{|||({{{{,,.,,..,,,},............,,}}}..})))},.|||,.||}.}}.})))))...)))))))}||||{{...,},}}}}))))(((((((((({({{((({..,((((({((({((((({{((..(,(((({,(((((({((({{.....,,|||||,.....((((((((((((.....(((((((((((((((...((({.{(((((......,,))))}....)))).)))).))))))))))).,....)))).))))))))....{(({.((((((((.......))))))))...}}}},((((((((((.{((..((..(((((...........)))))..))..))}))))))))))|{{{.(((((.((.((((.(((.(.((((((((((((..{.(((((((((((.(.(,(({(,.....,,,.,)))).)}))))))..))))).,.))))..)))))))).)))).((.((((((((((...((((,(((((((((((((((..(((((((..{(((((({{(,((({(((...(((((((((((((((((((((((({{,...((((...)))).)).)))))))))..)))).)))....,{{.{{....)),)))))))))))..{{(((((,(((.,,..}))})))))},,|,,|,..||||..||{(||,|||||,.||||....}}))}}))),)},)),,,.,,{{{,...,}}},,..,...,|,,,{((((..((((({.....((((.((((((((((((..{.(((((.,..(({.....(((....(((({.....))))).....))}....}}}.....})))),{||......|||.,,.,{,{{{.,{,,,(({{.,||,,.,.,.}))),})}).},,,,))))))))).))).))))...)))))).))))|{||,.......,,,}}.))))))))))))).)))))))},))).)))).,))))...))))))..)))).))......(((((((.....))))))}.)))).)).))))).}))))))))}}...,,,},,{||{{|}},,...,,,}|||,|||||}}}}))),)}))).),)))))|||||.{{|{{.{{{{..,,.{{{{,(((,,,..,,,..,,,.}}}|,||||,..}}))}((({{.({{(,.{((,...}}}.||.....|||{.....)))),,,,,.}||,||||.}}}},.)).))))))))))))))}})}))|||||{,...,||}}}}(((((.......)))))..}))),)))))))).))))))..)))))))).))))}.))))))...))))))))))...,..))))..}))),,,}))))))))))|||||{...{{{{{{.{{.{||,|||................,......|||,}||,,}},}}|}},..,}||.{{{||,,..))))}..)))))))))})}))))))))))),,}}}|}|))}.))))((((((.((.(((((((.((({...})))..))))))))).))))))))))}}|}}},},,}.)))))))}...................{{{|..|{{.....,))))))).

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_144570.3 NCBI
GGCGCGCGGCGAGCUGAGGGUGGCGGCGGUCGACAUGUUCCAGGUCCCG… 3695 nt 0.4853
Summary

Involved in endocytosis involved in viral entry into host cell and regulation of calcium-mediated signaling. Located in cytosol; nucleus; and plasma membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.