Basic Information
Symbol
JUNB
RNA class
mRNA
Alias
JunB Proto-Oncogene, AP-1 Transcription Factor Subunit
Transcription Factor AP-1 Subunit JunB
Transcription Factor JunB
Transcription Factor Jun-B
Jun B Proto-Oncogene
Activator Protein 1
AP-1
Location (GRCh38)
19:12791486-12793315
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
MANE select
Transcript ID
NM_002229.3
Sequence length
1830.0 nt
GC content
0.6486
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-821.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-851.81 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
429.84
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| GGGACCUUGAGAGCGGCCAGGCCAGCCUCGGAGCCAGCAGGGAGCUGGG… | 1830 nt | 0.6486 |
Summary
Enables sequence-specific double-stranded DNA binding activity. Involved in positive regulation of transcription by RNA polymerase II. Located in nucleoplasm. Part of transcription factor AP-1 complex. Implicated in head and neck squamous cell carcinoma and melanoma. Biomarker of gastrointestinal system cancer (multiple); lung non-small cell carcinoma; and lymphoma (multiple). [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]
Forensic Context
A study in rats demonstrated that the JUNB gene is a potential diagnostic marker for fatal hypothermia, as its expression in the iliopsoas muscle was significantly increased only by severe hypothermia and is involved in metabolic state and lipid metabolism [Umehara et al. DOI:10.1007/s00414-018-1888-3]. In human sepsis research, the JUNB transcription factor was identified as a biomarker, being highly expressed in almost all peripheral blood mononuclear cells and significantly up-regulated in sepsis patient blood samples as part of the IL-17 signaling pathway [Zhao et al. DOI:10.1016/j.imbio.2023.152763].