Basic Information
Symbol
JUND
RNA class
mRNA
Alias
JunD Proto-Oncogene, AP-1 Transcription Factor Subunit
AP-1
Transcription Factor AP-1 Subunit JunD
Transcription Factor Jun-D
Transcription Factor JunD
Activator Protein 1
Jun D Proto-Oncogene
JunD-FL Isoform
Location (GRCh38)
19:18279694-18281622
Forensic tag(s)
Individual identification
Mechanical injury analysis
MANE select
Transcript ID
NM_005354.6
Sequence length
1929.0 nt
GC content
0.6993
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-970.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-1001.08 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
389.30
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| AGGAGCCGCCGCCAGUGGAGGGCCGGGCGCUGCGGCCGCGGCCGGGGCG… | 1929 nt | 0.6993 | |
| AGGAGCCGCCGCCAGUGGAGGGCCGGGCGCUGCGGCCGCGGCCGGGGCG… | 1929 nt | 0.6993 |
Summary
The protein encoded by this intronless gene is a member of the JUN family, and a functional component of the AP1 transcription factor complex. This protein has been proposed to protect cells from p53-dependent senescence and apoptosis. Alternative translation initiation site usage results in the production of different isoforms (PMID:12105216). [provided by RefSeq, Nov 2013]
Forensic Context
A study in humans demonstrated that JUND, a housekeeping gene in the signaling and communication class, was differentially expressed between a male monozygotic twin pair and was also listed among the top 15 most highly expressed housekeeping genes with a low coefficient of variation across individuals [Sharma et al. DOI:10.1152/physiolgenomics.00228.2003]. In a separate investigation of severe burns, the related gene JUN was significantly upregulated in burn tissue in a mouse model, identifying it as a potential therapeutic target [Guo et al. DOI:10.1155/2022/5220403].