Basic Information

Symbol
KAT2B
RNA class
mRNA
Alias
Lysine Acetyltransferase 2B P/CAF P300/CBP-Associated Factor PCAF Spermidine Acetyltransferase KAT2B Histone Acetyltransferase KAT2B K(Lysine) Acetyltransferase 2B Histone Acetyltransferase PCAF Histone Acetylase PCAF EC 2.3.1.48 GCN5L GCN5 CREBBP-Associated Factor EC 2.3.1.57 CAF
Location (GRCh38)
3:20040400-20154404
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003884.5
Sequence length
4410.0 nt
GC content
0.4116

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1212.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1303.43 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1029.71
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_003884.5 NCBI
ACUCGGCGCCUCCUGCCGUGCUCCGGGGCGGCAUGUCCGAGGCUGGCGG… 4410 nt 0.4116
Summary

CBP and p300 are large nuclear proteins that bind to many sequence-specific factors involved in cell growth and/or differentiation, including c-jun and the adenoviral oncoprotein E1A. The protein encoded by this gene associates with p300/CBP. It has in vitro and in vivo binding activity with CBP and p300, and competes with E1A for binding sites in p300/CBP. It has histone acetyl transferase activity with core histones and nucleosome core particles, indicating that this protein plays a direct role in transcriptional regulation. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in porcine skin exposed to bromine vapor demonstrated that the KAT2B gene transcript was significantly decreased approximately 2.4-fold in both 10- and 20-minute exposure groups at 48 hours postexposure, identifying it as a component within significantly altered signaling pathways [Rogers et al. DOI:10.1002/jbt.20383].