Basic Information

Symbol
KAT6A
RNA class
mRNA
Alias
Lysine Acetyltransferase 6A MOZ Monocytic Leukemia Zinc Finger Protein ZC2HC6A RUNXBP2 ZNF220 MYST3 MYST Histone Acetyltransferase (Monocytic Leukemia) 3 Runt-Related Transcription Factor Binding Protein 2 MOZ, YBF2/SAS3, SAS2 And TIP60 Protein 3 Histone Acetyltransferase KAT6A K(Lysine) Acetyltransferase 6A Zinc Finger Protein 220 MYST-3 Runt-Related Transcription Factor-Binding Protein 2 Histone Acetyltransferase MYST3 EC 2.3.1.48 ARTHS MRD32
Location (GRCh38)
8:41929479-42051998
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Time since deposition estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006766.5
Sequence length
9153.0 nt
GC content
0.4542

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2751.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2920.55 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2591.41
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001305878.2 NCBI
ACUGUCUCCAAGAUGGCGGCCGUGUCAGUUUGGGGCAUCUCCGCGGUCC… 3592 nt 0.4251
NM_006766.5 NCBI
ACUGUCUCCAAGAUGGCGGCCGUGUCAGUUUGGGGCAUCUCCGCGGUCC… 9153 nt 0.4542
Summary

This gene encodes a member of the MOZ, YBFR2, SAS2, TIP60 family of histone acetyltransferases. The protein is composed of a nuclear localization domain, a double C2H2 zinc finger domain that binds to acetylated histone tails, a histone acetyl-transferase domain, a glutamate/aspartate-rich region, and a serine- and methionine-rich transactivation domain. It is part of a complex that acetylates lysine-9 residues in histone 3, and in addition, it acts as a co-activator for several transcription factors. Allelic variants of this gene are associated with an autosomal dominant form of cognitive disability. Chromosomal translocations of this gene are associated with acute myeloid leukemia. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2017]

Forensic Context

A study in human blood samples stored at 4°C demonstrated that the transcriptome degradation pattern could be divided into four distinct stages (days 0-2, 4-14, 21-56, and 84-168) [Zhang et al. DOI:10.1016/j.forsciint.2024.111930].