Basic Information

Symbol
KATNAL1
RNA class
mRNA
Alias
Katanin Catalytic Subunit A1 Like 1 Katanin P60 ATPase-Containing Subunit A-Like 1 Katanin Catalytic Subunit A Like 1 Katanin P60 Subunit A-Like 1 Katanin P60 Subunit A Like 1 P60 Katanin-Like 1 MGC2599 EC 5.6.1.1 EC 3.6.4.3
Location (GRCh38)
13:30202630-30307551
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_032116.5
Sequence length
7618.0 nt
GC content
0.3829

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2003.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2155.49 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2101.52
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001014380.3 NCBI
CUCUCUUUGUCUUGAGGGGGCUGUUGAGUGGUCGCGGACCUGGGCUCUG… 7469 nt 0.3741
NM_032116.5 NCBI
AGUCCCAAGCUCCGCCCCAGAGCGGACUCACAGCCCCCGCGCUCCCUCC… 7618 nt 0.3829
Summary

Enables identical protein binding activity and microtubule severing ATPase activity. Involved in microtubule severing. Located in cytosol; microtubule cytoskeleton; and mitochondrion. Part of katanin complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

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